如何读取 R 中的多个 .txt 文件并将其与多个行和列组合到一个数据框中？来自 Li-840 的数据答案

【问题标题】：How to read and combine multiple .txt files in R with multiple rows and columns into a single data frame? Data from Li-840如何读取 R 中的多个 .txt 文件并将其与多个行和列组合到一个数据框中？来自 Li-840 的数据
【发布时间】：2021-06-22 15:52:43
【问题描述】：

我正在尝试使用 R 来读取和合并多个 .txt 文件。我还想根据文件名添加列。 .txt 文件是使用 licor li-840 收集的气体交换数据。每个 .txt 文件都是单个样本的时间序列。命名方案是 year.month.day.Time.Shrub.Treatment.Sample（例如 2021.6.9.T0.20.w3.15）。 .txt 文件以日期和开始时间的行开头。第 2 行有 8 个列名。

为清晰起见进行编辑目标：

如何读取多个 .txt 文件
如何分隔文件名并添加为列
如何将 .txt 文件合并到单个数据帧中

在 cmets 中，我尝试了以下代码：

files <- map(.x = cfiles, ~read.delim(.x,skip=1, header=TRUE))
%>% bind_rows()
%>% map2(.y= cfiles, ~mutate(.x, campaign = .y))

输出错误是：

Error in UseMethod("mutate") :
no applicable method for 'mutate' applied to an object of class "character"

.txt 文件的一个示例是：文件名：2021.6.9.T0.20.w3.15

sample data image

【问题讨论】：

标签： r

【解决方案1】：

您可以使用 purrr 和 dplyr::bind_rows 轻松完成此操作

names 将是您的文件列表。

files <- map(.x = names, ~read.delim(.x)) %>%
          bind_rows()%>%
          map2(.y= names, ~mutate(.x, campaign = .y))

我以前也有过这种数据结构。

purrr:map() 迭代一个列表，purrr:map2() 迭代两个列表。

【讨论】：

我对 R 非常陌生，这是我第一次使用 txt 文件。到目前为止，我只有在文件中读取的代码：conductance_data
我重新审视了这个问题，并能够创建文件列表。我修改了您的代码以删除 .txt 文件的第一行并将第二行用作标题。文件 % bind_rows()%>% map2(.y= cfiles, ~mutate(.x, 活动= .y)) 当我运行该行时，它返回此错误： UseMethod("mutate") 中的错误：没有适用于“mutate”的方法应用于“character”类的对象