读取多个文件并将数据保存到 R 中的一个数据帧中答案

【问题标题】：Read multiple files and save data into one dataframe in R读取多个文件并将数据保存到 R 中的一个数据帧中
【发布时间】：2013-05-28 05:46:08
【问题描述】：

我正在尝试读取多个文件，然后将它们组合成一个数据帧。我使用的代码如下：

library(plyr)
mydata = ldply(list.files(path="Data load for stations/data/Predicted",pattern = "txt"), function(filename) {
  dum = read.table(filename,skip=5, header=F, sep=" ")

  #If you want to add the filename as well on the column

  dum$filename = filename
  return(dum)
})

我得到的错误如下：

Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(file, "rt") :
  cannot open file 'mobdata201001.txt': No such file or directory

数据文件可以在https://www.dropbox.com/sh/827kmkrwd0irehk/BFbftkks42找到

非常感谢任何帮助。

【问题讨论】：

您是否尝试过仅使用您提供的路径和文件名加载一个文件？您收到的错误似乎找不到文件。也许只是在路径中添加一个额外的“/”？
如果这些是与动物园一致的时间序列，那么read.zoo 可以读取多个文件，从中创建一个动物园对象。

标签： r dataframe plyr

【解决方案1】：

或者，您可以在list.files 中使用参数full.names：

list.files(path="Data load for stations/data/Predicted",
           pattern = "txt", full.names=TRUE)

它会在文件名前自动添加完整路径。

【讨论】：

【解决方案2】：

试试下面的代码：

library(plyr)
path <- "Data load for stations/data/Predicted/"
filenames <- paste0(path, list.files(path, pattern = "txt"))
mydata = ldply(filenames, function(filename) {
  dum = read.table(filename,skip=5, header=F, sep=" ")

  #If you want to add the filename as well on the column

  dum$filename = filename
  return(dum)
})

我认为正在发生的事情是您正在生成一个相对于 list.files 中的路径的文件列表，然后要求 read.table 获取文件名而不使用路径的其余部分...

【讨论】：