【问题标题】:Random sample from given bivariate discrete distribution来自给定双变量离散分布的随机样本
【发布时间】:2011-01-17 21:39:29
【问题描述】:

假设我有一个二元离散分布,即概率值表 P(X=i,Y=j),对于 i=1,...n 和 j=1,...m。如何从这种分布中生成随机样本 (X_k,Y_k), k=1,...N?也许有一个现成的 R 函数,例如:

sample(100,prob=biprob)

biprob 是二维矩阵在哪里?

一种直观的采样方式如下。假设我们有一个 data.frame

dt=data.frame(X=x,Y=y,P=pij)

x 和 y 来自哪里

expand.grid(x=1:n,y=1:m)

和 pij 是 P(X=i,Y=j)。

然后我们得到大小为 N 的样本 (Xs,Ys),方法如下:

set.seed(1000) 
Xs <- sample(dt$X,size=N,prob=dt$P)
set.seed(1000)
Ys <- sample(dt$Y,size=N,prob=dt$P)

我使用 set.seed() 来模拟“二元性”。直觉上我应该得到类似于我需要的东西。我不确定这是正确的方法。因此问题:)

另一种方法是使用吉布斯抽样,边际分布很容易计算。

我尝试使用谷歌搜索,但没有找到真正相关的内容。

【问题讨论】:

    标签: r statistics


    【解决方案1】:

    你快到了。假设您有带有 x、y 和 pij 值的数据框 dt,只需对行进行采样!

    dt <- expand.grid(X=1:3, Y=1:2)
    dt$p <- runif(6)
    dt$p <- dt$p / sum(dt$p)  # get fake probabilities
    idx <- sample(1:nrow(dt), size=8, replace=TRUE, prob=dt$p)
    sampled.x <- dt$X[idx]
    sampled.y <- dt$Y[idx]
    

    【讨论】:

    • 再次仔细阅读,这与我建议的解决方案相同。采样行可能比组合 rmultinom 和 which 更干净。关键是要意识到行和列只是符号。
    • 是的,符号是关键。双变量离散分布与符号改变的单变量离散分布相同。我选择 Anika 的答案作为正确答案,但这只是因为代码更简单 :) Tristan 给出了更好的理论解释。
    【解决方案2】:

    我不清楚为什么你应该关心它是双变量的。概率总和为 1,结果是离散的,因此您只是从 categorical distribution 中抽样。唯一的区别是您使用行和列而不是单个位置来索引观察。这只是符号。

    因此,在 R 中,您可以通过重塑数据和从分类分布中抽样来轻松地从分布中抽样。可以使用rmultinomwhich 来选择索引,或者像Aniko 建议的那样,使用sample 来对重构后的数据行进行采样,从而对分类进行采样。一些簿记可以处理您的具体情况。

    这里有一个解决方案:

    library(reshape)
    
    # Reshape data to long format.
    data <- matrix(data = c(.25,.5,.1,.4), nrow=2, ncol=2)
    pmatrix <- melt(data)
    
    # Sample categorical n times.
    rcat <- function(n, pmatrix) {
        rows <- which(rmultinom(n,1,pmatrix$value)==1, arr.ind=TRUE)[,'row']
        indices <- pmatrix[rows, c('X1','X2')]
        colnames(indices) <- c('i','j')
        rownames(indices) <- seq(1,nrow(indices))
        return(indices)
    }
    
    rcat(3,pmatrix)
    

    这会从您的矩阵中返回 3 次随机抽取,报告行和列的 ij

      i j
    1 1 1
    2 2 2
    3 2 2
    

    【讨论】: