从命令行启动时，无法在 r 脚本中使用 igraph

Question

我编写了一个 R 脚本，我使用命令 source("script.r") 从 R 运行该脚本。效果很好。

但是，当我尝试使用以下任一命令从命令行运行完全相同的脚本时：Rcript script.r、R --vanilla < script.r 或 R CMD BATCH script.r 我收到错误消息： “库中的错误（igraph）：没有名为 'igraph' 的包”

如果我从脚本中删除该行并在没有命令library(igraph) 的情况下运行它，那么我会得到函数graph.frame.data 找不到的错误，这是igraph 的一个函数。 从 Rstudio 运行的脚本不包含 library(igraph) 行，我没有收到这样的错误。

当我试图告知自己从脚本运行 igraph 的问题时，我没有找到任何其他信息。

更多信息：我正在从多个文件构建一个图表，然后在该创建的图表上使用 igraph 库进行计算。这是在一个循环中执行的，该循环遍历所有（特定）目录。使用cat(..) 将输出写入文件。

提前感谢您的帮助。

Answer 1

igraph 库未安装到默认库位置。 使用命令library("igraph", lib.loc="..igraph.location..") 解决了这个问题。

库已加载，脚本的执行顺利进行。