python3.7 biopython，怎么学python3还是用biopython答案

【问题标题】：python3.7 biopython, how to learn python3 and still use biopythonpython3.7 biopython，怎么学python3还是用biopython
【发布时间】：2018-07-25 15:16:51
【问题描述】：

我对 python 和 biopython 非常陌生，目前使用的是 mac。我有 python v2.7 和 v3.7，我想学习 python3。 Biopython 仅适用于 v2.7。是否值得安装 python V3.4 以及其他 2 个版本，以便我可以学习 python3 并使用 biopython？还是去掉python3.7，加上3.4？即使我安装了 python3.4，如果之前安装了 biopython 也可以工作吗？非常困惑的生物学家。

【问题讨论】：

每个问题一个问题，请。
根据this的说法，biopython最高支持Python3.6，文档一年没更新了。它可能适用于 Python 3.7，因为没有太多重大更改
@user3080953 在下一个 1.73 版本发布之前，Biopython 官方将不支持 Python 3.7。 Biopython 1.72（我写这篇文章时的当前版本）仅支持 Python 3.6。但是，实际上应该没问题，我知道开发人员已经为 1.72 版本修复了许多与 Python 3.7 相关的问题github.com/biopython/biopython/blob/master/…

标签： python biopython

【解决方案1】：

首先，请查看此页面：https://biopython.org/wiki/Download 您不必担心 biopython 被绑定到特定版本的 python - 您可以将它与 v2.7 或 v3.4/v3.5/v3.6 一起使用。您还可以在系统上安装多个版本，但我建议您专注于深入挖掘其中一个。就个人而言，我现在使用 python3.x（目前是 3.6）工作了几年，但我知道很多人坚持使用 v2.7。

还具有生物信息学背景，我可以在您的旅程开始时向您强烈推荐的一件事是参加以下课程： https://www.coursera.org/specializations/python youtube 上还有很多免费教程 - 您可以通过搜索“python 教程”或“python 入门”轻松找到适合您需求的教程。

让自己熟悉该语言，了解数据结构、数据库和数据可视化等基础知识。还可以查看一些“python 备忘单”——它们可以帮助您了解该语言的基本概念。一切顺利，继续编码！

【讨论】：

请记住，python2 将在 2 年内不再维护。每个新用户都应该从 python3 开始。
感谢您的评论 - 在这里提一下很重要！
正式 Python 3.7 将在下一个 1.73 Biopython 版本中得到支持，请看我在问题下的评论
好的，非常感谢您的帮助，我还是有点卡住抱歉。我也下载了python3.6.6，我想用它来学习python。按照 Biopython 网站上的说明，在 python 中尝试输入“import Bio”以测试 Biopython 是否已正确下载。当我在 python2.7 中时，>>>'import Bio' 不会给出错误消息，所以我认为它正在工作。但是当我在 Biopython3.6 或 3.7 中时，>>>'import Bio' 给了我错误消息'Module Not Found'。如何修复它以便 Biopython 可以从 python3.6 运行？
您似乎下载了适用于 v2.7 的 Biopython，但没有下载适用于 v3.6 的 Biopython。请始终检查您使用的是哪个版本的 python（在 Linux 终端上：哪个 python；哪个 pip）以查明您的安装位置。

【解决方案2】：

来自biopythoninstallation document：

Biopython 旨在与 Python 2.5 到 2.7 兼容。 Python 2.7 是最终的 2.x 系列版本，这将是我们推荐的版本（假设您计划使用的所有其他 Python 库都支持它）。

升级错误修复版本（例如 2.6.1 到 2.6.2）非常简单，不需要重新安装任何库。

版本之间的升级（例如 2.6 到 2.7）更耗时，因为您需要重新安装已添加到 python 的所有库。

从 Biopython 1.62 开始，我们正式支持 Python 3，特别是 Python 3.3。不支持 Python 3.0、3.1 和 3.2。

同样来自 Biopython website:

Python 2.7、3.4、3.5 或 3.6 或 PyPy，包括 Python 开发头文件，如 python.h

所以 biopython 与他们的文档不一致。

我认为你最好的选择是下载最新版本的 Python 2 或 3，看看它是否有效。

【讨论】：

好的，非常感谢您的帮助，我还是有点卡住抱歉。我也下载了python3.6.6，我想用它来学习python。按照 Biopython 网站上的说明，在 python 中尝试输入“import Bio”以测试 Biopython 是否已正确下载。当我在 python2.7 中时，>>>'import Bio' 不会给出错误消息，所以我认为它正在工作。但是当我在 Biopython3.6 或 3.7 中时，>>>'import Bio' 给了我错误消息'Module Not Found'。我该如何修复它以便 Biopython 可以从 python3.6 运行？
我正在回复自己，以防其他人有同样的问题，因为我已经解决了。我读到即使 biopython 现在在我的 mac 上的 python2.7 中，我也应该将 biopython 重新安装/重新下载到 python3.6 中。所以我在终端中使用了这段代码：python3.6 -m pip install biopython 之后我还下载了 python3.6，现在我在 2.7 和 3.6 中分别拥有 biopython。
模块是按 python 版本下载的，而不是跨每个版本下载的。未来要记住的事情。