R - 没有通过点正确拟合的黄土曲线

Question

我正在尝试过滤掉太靠近或低于黄土曲线的点：

结果如下：

显然不是预期的结果。

但是，如果我使用 scatter.smooth 函数，我会得到正确的曲线：

如何通过我的数据正确拟合黄土曲线？

Answer 1

主要是检查predict函数返回的内容：

head(predict(afit))
[1] 0.8548271 0.8797704 0.8584954 0.8031563 0.9012096 0.8955874

它是一个向量，所以当我们将它传递给lines 时，R 会说，“好吧，你没有指定 x 值，所以我将只使用 x 值的索引”（试试@ 987654326@ 了解我的意思）。

所以，我们需要做的是指定一个 2 列矩阵传递给lines，而不是：

cbind(sort(means), predict(afit, newdata = sort(means)))

应该可以解决问题。你的函数可以写成：

FilterByVariance<-function(dat, threshold = 0.90, span = 0.75){
means <- apply(dat,1,mean) 
sds <- apply(dat,1,sd) 
cv <- sqrt(sds/means)

afit<-loess(cv~means, span = span)
resids<-afit$residuals
# good<-which(resids >= quantile(resids, probs = threshold)) 
# points above the curve will have a residual > 0
good <- which(resids > 0)
#plots

plot(cv~means)
lines(cbind(sort(means), predict(afit, newdata = sort(means))), 
      col="blue",lwd=3)
points(means[good],cv[good],col="red",pch=19)

}