如何使用 NiBabel (Python) 预处理 NIfTI 数据格式答案

【问题标题】：How to preprocess NIfTI data format using NiBabel (Python)如何使用 NiBabel (Python) 预处理 NIfTI 数据格式
【发布时间】：2019-03-05 19:37:45
【问题描述】：

使用 NiBabel 将 NIfTI 文件转换为数组后，数组具有三个维度，数字如下所示：

[-9.35506855e-42 -1.78675141e-35  1.18329136e-30 -1.58892995e-24
5.25227377e-24  1.11677966e-23 -2.41237451e-24 -1.51333104e-25
6.79829196e-30 -9.84047188e-36  1.23314265e-43 -0.00000000e+00]

如何预处理此数组以进行机器学习？当只选择指数时，大部分信息在绘制图像时会丢失，所以也许底数也很重要？

感谢任何帮助。

【问题讨论】：

标签： python machine-learning computer-vision neuroscience nibabel

【解决方案1】：

这将帮助您将 niftiimage 转换为作为 numpy 数组访问：

img = nib.load(example_filename)
data = img.get_fdata()

【讨论】：

谢谢。我已经这样做了，但是 numpy 数组看起来像我上面提到的那个。您知道如何预处理数组以便我可以使用机器学习算法（例如 Keras）吗？
我也在学习。在你问这个问题的几个小时前，我才弄清楚数组的事情。如果你这样做了，请告诉我。在 stackoverflow 上有聊天吗？
这是我到目前为止的想法：
这是我到目前为止的想法：通过使用 np.asarray(data) 您可以将数据转换为 numpy 数组，并使用 np.uint8(data*255) 将数组中的数字看起来好多了 + 您现在可以将其视为图像（来自 PIL 导入图像，data = data.transpose(2,0,1).reshape(-1,data.shape[1])，img = Image.fromarray (bildneu, 'L'), img.save('final.png'), img.show())。
你好，你们能帮我写这篇文章吗？ stackoverflow.com/questions/56698087/…