只要你有均值向量和协方差矩阵,通过MASS:::mvrnorm 模拟多元正态非常简单。看看?mvrnorm如何使用这个功能。
如果您对协方差矩阵没有特殊要求,即随机协方差矩阵即可。您需要先创建一个合适的协方差矩阵。
协方差矩阵必须是正定的。我们可以通过取满秩矩阵的叉积来创建正定矩阵。也就是说,如果n * p (n >= p) 矩阵X 具有完整的列秩,则A = X' %*% X 是正定的(因此具有适当的协方差)。
我们先生成一个随机的X矩阵:
p <- 100 ## we want p-dimensional multivariate normal
set.seed(0); X <- matrix(runif(p * p), p, p) ## this random matrix has full rank
然后得到一个协方差矩阵:
COV <- crossprod(X) ## t(X) %*% X but about 2 times faster
我们还需要均值向量。假设它们是 0 均值:
mu <- rep(0, p)
现在我们调用MASS:::mvrnorm 进行随机抽样:
library(MASS) ## no need to install
x <- mvrnorm(1000, mu, COV) ## mvrnorm(sample.size, mean, covariance)
现在x 包含来自 100 维(p 维)多元正态分布的 1000 个样本,均值 mu 和协方差 COV。
> str(x)
num [1:1000, 1:100] 1.66 -2.82 6.62 6.46 -3.35 ...
- attr(*, "dimnames")=List of 2
x 是一个矩阵,其中每一行都是一个随机样本。所以我们总共有 1000 行。
对于多元正态,边际分布仍然是正态的。因此,我们可以绘制边缘的直方图。下图为第 1、10、20 和 30 边距:
par(mfrow = c(2,2))
hist(x[, 1], main = "1st marginal")
hist(x[, 10], main = "10th marginal")
hist(x[, 20], main = "20th marginal")
hist(x[, 30], main = "30th marginal")