如何将两个因子转换为R中的邻接矩阵？

Question

我有一个包含两列（键和值）的数据框，其中每一列都是一个因素：

df = data.frame(gl(3,4,labels=c('a','b','c')), gl(6,2))
colnames(df) = c("key", "value")
   key value
1    a     1
2    a     1
3    a     2
4    a     2
5    b     3
6    b     3
7    b     4
8    b     4
9    c     5
10   c     5
11   c     6
12   c     6

我想将其转换为邻接矩阵（在本例中为 3x6 大小），例如：

  1 2 3 4 5 6
a 1 1 0 0 0 0
b 0 0 1 1 0 0
c 0 0 0 0 1 1

这样我就可以使用 kmeans 或 hclust 在其上运行集群（将具有相似值的键组合在一起）。

我能得到的最接近的是使用 model.matrix( ~ value, df) ，结果是：

   (Intercept) value2 value3 value4 value5 value6
1            1      0      0      0      0      0
2            1      0      0      0      0      0
3            1      1      0      0      0      0
4            1      1      0      0      0      0
5            1      0      1      0      0      0
6            1      0      1      0      0      0
7            1      0      0      1      0      0
8            1      0      0      1      0      0
9            1      0      0      0      1      0
10           1      0      0      0      1      0
11           1      0      0      0      0      1
12           1      0      0      0      0      1

但结果尚未按键分组。

另一方面，我可以使用以下方法将此数据集折叠成组：

aggregate(df$value, by=list(df$key), unique)
  Group.1 x.1 x.2
1       a   1   2
2       b   3   4
3       c   5   6

但我不知道下一步该做什么......

有人可以帮忙解决这个问题吗？

Answer 1

在baseR 中实现这一点的简单方法：

res <-table(df)
res[res>0] <-1
res
   value
#key 1 2 3 4 5 6
#  a 1 1 0 0 0 0
#  b 0 0 1 1 0 0
#  c 0 0 0 0 1 1