来自数据帧的邻接矩阵与 igraph R答案

【问题标题】：Adjacency matrix from dataframe with igraph R来自数据帧的邻接矩阵与 igraph R
【发布时间】：2019-03-06 07:59:08
【问题描述】：

我是 R 和图形方面的新手，我正在尝试使用 igraph 库在社交签名网络上进行练习。

我有一个包含三列的数据框 (df)。第一个是投票者，第二个是收到投票的用户，第三个是投票（-1 或 1，分别取决于反对票或赞成票）。

> head(df)

     voter        user      vote
1    ludraman     cjcurrie     1
2    blankfaze    olivo       -1
3    gzornenplatz cjcurrie     1
4    orthogonal   olvion       1
5    andrevan     cerviz       1
6    texture      cjcurrie     1

我想用 igraph 创建一个图，但首先我需要从 df 获取邻接矩阵。

我尝试了图书馆的sharpshootR

A <- component.adj.matrix(df[, c(1,2)], mu=df[, 1], co=df[, 2], wt=df[, 3])

有没有一种使用 igraph 库获取邻接矩阵的简单方法？

谢谢。

【问题讨论】：

请在下方发布您的答案，而不是在问题内。

标签： r networking graph igraph

【解决方案1】：

如果我没看错你的问题，你可以使用 graph_from_data_frame from igraph 本身：

数据

d <- structure(list(voter     = c("ludraman", "blankfaze", "gzornenplatz", "orthogonal", 
                                  "andrevan", "texture"), 
                    user      = c("cjcurrie", "olivo", "cjcurrie", "olvion", "cerviz", "cjcurrie"), 
                    vote      = c(1L, -1L, 1L, 1L, 1L, 1L)), 
                    row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"), class = "data.frame")

igraph

library(igraph)
g <- graph_from_data_frame(d)
plot(g)

您可能可以从 tehre（给定您的完整数据）开始使用可视化中数据的其他部分（例如分数）。

【讨论】：

谢谢！但是我的数据库太长了。我不能手写所有的名字和选票。
你可以试试dput(head(your_data, nr_of_rows))，它会给你一个输出，你可以简单地复制粘贴到这里。

【解决方案2】：

此解决方案适用于我的问题：

edge_list <- training_edges[df].                # create a edge list
G <- graph.data.frame(edge_list, directed=TRUE) # create the graph

A <- as_adjacency_matrix(G,type="both",names=TRUE,
sparse=FALSE, attr = "vote")                    # create the adjacency matrix

其中 A 是邻接矩阵。

【讨论】：