如何在 Python 中捕获 rpy2.rinterface.RRuntimeError？答案

【问题标题】：How do I catch an rpy2.rinterface.RRuntimeError in Python?如何在 Python 中捕获 rpy2.rinterface.RRuntimeError？
【发布时间】：2017-11-15 12:01:52
【问题描述】：

设置：

Python 3.5.3 |Continuum Analytics, Inc.| （默认，2017 年 3 月 6 日，12:15:08）
Mac OSX 10.13.1

问题：

我已经下载了以下R脚本https://github.com/daleroberts/heston/blob/master/heston.r 我使用包 RPy2 通过 Python 反复调用其中的一个函数。现在，对于我提供给 R 函数的一些输入，R 返回以下错误：

rpy2.rinterface.RRuntimeError：集成错误（PIntegrand，lower = 0, upper = Inf, lambda, vbar, eta, : 检测到舍入误差

如何在 Python 中捕获这个 RuntimeError？

【问题讨论】：

标签： python r exception-handling runtime-error

【解决方案1】：

RRuntimeError 派生自 Exception，因此您应该能够像处理任何其他异常一样捕获它。

try:
    # your code
except rpy2.rinterface.RRuntimeError:
    # handle exception

在 rpy2 v3.0 及更高版本中，RRuntimeError 似乎已移至别处（参见示例代码 from documentation），因此您可能需要改用它：

try:
    # your code
except rpy2.rinterface_lib.embedded.RRuntimeError:
    # handle exception

【讨论】：

可能在这个路径下rpy2.rinterface.embedded.RRuntimeError
@wassname 是的，你可能是对的，我可能只是删除对源代码的引用，因为它最终总会过时。

【解决方案2】：

Python 使得捕获异常变得相对容易。

try:
    # some code
except Exception, e:
    # Log the exception.

【讨论】：

RuntimeError 是 Python 中的一个异常。 docs.python.org/2/library/…

【解决方案3】：

我无法让rpy2.rinterface.RRuntimeError 工作，但下面的解决方法对我有用。

安装tryCatchLog:

%%R
install.packages('tryCatchLog')
library('tryCatchLog')

如果在函数中使用它：

def test_R_error_handling():
  %R tryCatchLog( expr = result <- 'a'+2, finally = result <- -1 )
  result = ro.globalenv['result'][0]
  if result == -1:
    print(result)
    return
  else:
    print('\nFunction continued')
    return True

这是关于 rpy2 错误处理的my post。我希望这对遇到同样问题的人有所帮助。

【讨论】：