细胞计数：选择性；只计算所有染色阳性的细胞

Question

如果我在不同的荧光通道中拍摄多张图像（在用一些抗体/标记物染色细胞后），我如何自动定量每个标记物阳性细胞的比例？有人用 Python 做过类似的事情吗？

我已经可以使用 Fiji (ImageJ) 来计算仅包含一种染色类型的细胞，但我不能让它对包含两种染色类型的合并图像进行选择性计数。由于 Fiji 与 python 交互良好，我正在考虑编写一个脚本，查看每个仅包含一种染色类型的图像，然后获取相应图像的 x-y 坐标并检查它们之间的匹配。我不确定这是否是个好主意，我想知道是否有人做过类似的事情或有更有效的方式来完成任务？

感谢您的帮助！

Answer 1

您可以使用 cont = cv2.findcontours 找到几乎圆形的单元格并计算它们 与 len（续）。