使用 graph_from_data_frame 在 igraph 中绘制孤立节点。失踪

Question

我正在使用带有“from”和“to”列的 data.frames，我想从中创建网络图。

例如：

mydata <- data.table(from=c("John", "John", "Jim", "Jesse"),
   to=c("John", "Jim", "Jack", NA))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=T)
plot(mygraph, vertex.label.dist=2) 

该 NA 的存在会产生错误。

如果我只是删除 NA 行，则不会绘制孤独的节点。

mydata <- data.table(from=c("John", "John", "Jim"),to=c("John", "Jim", "Jack"))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=T)
plot(mygraph, vertex.label.dist=2) 

我希望得到与使用相同的结果：

g4 <- graph( c("John", "Jim", "Jim",  "Jack", "John", "John"), isolates=c("Jesse") )  
plot(g4,  vertex.label.dist=2) 

但使用两列，从和到。 我怎样才能得到相同的结果？ 当“from”或“to”中的任何一个为 NA 时，只需绘制没有边且不会产生错误的节点。

Answer 1

获得所需内容的一种方法是省略单个节点，然后使用 add_vertices 添加它

library(igraph)
mydata <- data.frame(from=c("John", "John", "Jim"),
   to=c("John", "Jim", "Jack"))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=T)
mygraph = add_vertices(mygraph, 1, name="Jesse")
plot(mygraph, vertex.label.dist=2)