【发布时间】:2013-12-08 00:29:48
【问题描述】:
看了这个问题后:Numeric comparison difficulty in R
我仍然卡住了,因为我依赖于在某些我无法编辑(或者我可以吗?)的函数中进行的等式比较
我在本地环境中测试三个数字的总和是否为一个 (sum(p)==1 --> TRUE),但是当我将这个由三个数字组成的向量传递给另一个函数时,类似的相等性测试失败 - 这让我认为这些数字正在当它们从一个函数传递到下一个函数时发生变化 - 这可能吗?
更多细节:我正在尝试“优化”输入 CART 模型的先验概率,使用优化器 (dfoptim package, nmkb) 选择先验组合,将它们发送到 rpart 包进行模型拟合,然后用于评分的验证(rps 函数)包 - 但在 rpart 包中的某处,我的先验概率抛出错误,因为rpart 认为它们不总和为 1。 p>
这是一个可重现的例子:
require('rpart')
require('verification')
require('dfoptim')
data(iris)
set.seed(1)
tmp1 <- paste0(names(iris),collapse="+")
tmp2 <- gsub("\\+Species","",tmp1)
fmlatext <- paste0("Species~",tmp2)
tree <- rpart(as.formula(fmlatext),data=iris,method="class")
objfun <- function(priors,fmlatext,data){
p <- priors/sum(priors) # turn arbitrary threesome into numbers that sum to 1
p[1] <- 1-(sum(p)-p[1]) # ensure that numbers sum to 1
print(c(p,sum(p)),digits=16)
tree <- rpart(as.formula(fmlatext),data=data,parms=list(prior=p),
method="class")
rpst <- rps(data$Species,predict(tree,data=data))
return(rpst$rpss)
}
nlev <- nlevels(iris$Species)
guess <- seq(nlev)*10
lb <- rep(1,nlev)
ub <- rep(100,nlev)
bestpriors <- nmkb(par=guess,fn=objfun,lower=lb,upper=ub,
control=list(maximize=TRUE),fmlatext=fmlatext,data=iris)
运行这段代码会给我这个输出:
[1] 0.1666666666666667 0.3333333333333333 0.5000000000000000 1.0000000000000000
[1] 0.4353687449261023 0.2354416940871099 0.3291895609867877 1.0000000000000000
[1] 0.1224920651311070 0.5548713793562775 0.3226365555126156 1.0000000000000000
[1] 0.1268712138061573 0.2390044736120877 0.6341243125817551 1.0000000000000000
[1] 0.35141687748184969 0.57028058689316308 0.07830253562498726 1.00000000000000000
[1] 0.2997590406445614 0.5077659444797995 0.1924750148756391 1.0000000000000000
[1] 0.3598141573675122 0.4350423262345758 0.2051435163979119 0.9999999999999999
Error in get(paste("rpart", method, sep = "."), envir = environment())(Y, :
Priors must sum to 1
在我的真实代码中,这种情况不一致地发生,具体取决于数据和猜测值,但它确实发生了,而且真的很痛苦。
我怎样才能克服这个错误? 干杯,R
【问题讨论】:
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如果将输入 (
p) 截断为 3 或 4 位精度会怎样?错误还会继续吗? -
截断是什么意思?我试过
p <- round(priors/sum(priors),2)并在实践中仍然看到错误。 -
为什么不创建一个额外的虚拟变量,'leftover
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Carl - 我不确定这会有什么帮助 - 问题是我正在发送三个数字,它们的总和为 1 [在
objfun环境中] 到rpart,但是当rpart检查它们,它们不再等于 1。leftover将如何帮助我?
标签: r precision equality rpart