在 rmarkdown/knitr 中使用 R 代码创建附录答案

【问题标题】：Create appendix with R-code in rmarkdown/knitr在 rmarkdown/knitr 中使用 R 代码创建附录
【发布时间】：2016-02-02 19:47:42
【问题描述】：

是否可以在附录中获取所有代码。假设我在一个文档中有两个块，然后是一些文本。

```{r, echo=TRUE}
x <- 4+5
x
```  
Above is X output.

```{r, echo=TRUE}
y <- 22+325
y
```   

Above is Y output.

然后我希望将所有代码放在附录中，但显示时好像我将 eval=FALSE 放在了块中。

类似的东西

```{r, SHOW_ALL_CODE=TRUE}
```

预期输出：

Chunk_1
x <- 4+5  
x

Chunk_2  
y <- 22+325  
y

【问题讨论】：

【解决方案1】：

另一种可能性：

### Appendix 
```{r, ref.label=knitr::all_labels(),echo=TRUE,eval=FALSE}
```

【讨论】：

【解决方案2】：

knitr::purl() 可以将 Markdown 文件中的所有 R 代码提取到 R 脚本中。您可以将其添加为附录。

## appendix

```{r code=readLines(knitr::purl('~/path/to/file.Rmd', documentation = 0)), eval = FALSE}

```

【讨论】：

【解决方案3】：

您可以使用对初始块的引用，然后更改选项：

main text

```{r blah, echo = FALSE}
summary(cars)
```

appendix

```{r blah2, ref.label='blah', eval = FALSE}
```

这会给：

【讨论】：

有时我有/想将某些功能的代码放在报告的附录中。我知道最初的问题是关于“所有”代码块的。最终，这个答案并没有提供“所有”块。这是一种将内容添加到 Rmd 文档的附录并允许编写周围文本的直观方式。其他答案显示了如何以编程方式执行此操作。 Yihui 有一篇关于使用 knitr::all_labels 和子集或使用 appendix = TRUE 的帖子。对于我未来的我：想想你想用附录中的代码做什么！这个可以带你走很远。