Rmarkdown & {knitr}：列表中的代码块亮点？答案

【问题标题】：Rmarkdown & {knitr}: code chunk highlights in lists?Rmarkdown & {knitr}：列表中的代码块亮点？
【发布时间】：2016-03-29 20:30:19
【问题描述】：

我有一个两级有序列表，输出与this post 相同。 我的输出很好，看起来应该如何。我的问题是块的正常“突出显示”消失了 8 个空格，并且 RMD 源不再“识别”这些块。块前后的空行也是缩进的（我发现我必须这样做才能获得所需的输出）。

为了说明这一点，我将分享下面的图片。缺少高亮显示，并且其他块中的相同光标位置在 line 旁边提供了一个小按钮：左下角的字符而不是“（顶级）”。如果我将块缩进（从 8 个空格变为 4 个）带入，则代码不再与输出中的列表对齐。

有没有办法解决这个问题？没有任何运气在线搜索或浏览文档。（如果有兴趣，示例来自 ISLR，第 2.4 节，练习 8。）

【问题讨论】：

我怀疑问题在于标记 R 代码的反引号（“```”）不在它们出现的行的开头
我试过了，但无济于事。将 8 个空格倒置为 4 个会导致列表的对齐关闭（即，块缩进一次，而列表项缩进两次）。在较早的块（缩进四个空格）中，这不是问题。只有八个空格才会成为问题。
This post 可能有用。
感谢分享 - 我之前遇到了那个链接。问题是，输出正是我想要的。我的问题是RMD（或{knitr}？）没有突出显示该块，并且进一步，没有将其“识别”为八个空格的块（在RMD中）。四个空格可以，八个不行。只是想弄清楚如何补救......这是我需要在某个地方调整的选项吗？

标签： r markdown knitr r-markdown

【解决方案1】：

好的，开始工作了。出于某种原因，在 R Studio 中按两次制表符（四个空格）会导致上述问题。我怀疑它与 R Studio 而不是 R Markdown 或 {knitr} 有关。解决方案是@Yihui 的this response，依赖于使用indent 参数。这将保持块的突出显示和识别以及保持输出中的所有内容对齐。

我从没想过要使用 indent 参数，因为它没有在当前 R Markdown 参考指南 (here) 的 {knitr} 块选项中列出，只是在 末尾被动提及{knitr} 块选项 (here) 中的代码说明部分。

【讨论】：

【解决方案2】：

我发现如果我将代码的缩进保持在相应文本的缩进级别上，一切都会很好地呈现：

1. One level of indention
    * Two levels of indention
        * Three levels of indention
            * Four levels of indention
                ```{r,eval=FALSE}
                Some("R code")
                ```

【讨论】：

感谢您对此的所有帮助和想法。我更新了原帖中的图片，希望它能更好地反映我的问题/问题。
为此，您需要使用嵌套的markdown lists 缩进，以便降价编译器可以检测当前的缩进级别。在您的示例中，您使用的是 (a),(b),i. 和 ii.，它们不是降价列表标识符。
抱歉延迟 - 我下载了最新版本的 R Studio，并确保所有包都是最新的。相信我对嵌套降价列表使用了正确的语法，问题仍然存在。缩进（四个空格）两次会导致与 OP link 相同的问题。即使在第二级使用星号也是同样的问题。有什么想法吗？
快速检查：上面的例子有效吗？如果没有，你能发一个reproducible example吗？
将上述示例复制粘贴到 R Studio 中会产生相同的输出，但突出显示问题仍然存在 here。我怀疑这是 R Studio 的问题，而不是 R Markdown 或 {knitr} 中的问题。虽然我无法直接解决手头的问题，但我确实使用 indent 块选项解决了问题。