【发布时间】:2012-04-25 15:44:01
【问题描述】:
给定一个均值和一个方差,是否有一个简单的函数调用来绘制正态分布?
【问题讨论】:
标签: python matplotlib
给定一个均值和一个方差,是否有一个简单的函数调用来绘制正态分布?
【问题讨论】:
标签: python matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import scipy.stats as stats
import math
mu = 0
variance = 1
sigma = math.sqrt(variance)
x = np.linspace(mu - 3*sigma, mu + 3*sigma, 100)
plt.plot(x, stats.norm.pdf(x, mu, sigma))
plt.show()
【讨论】:
%matplotlib inline 让情节显示出来
scipy.stats.norm.pdf(x, mu, sigma) 而不是mlab.normpdf(x, mu, sigma)
numpy并且可以使用np.sqrt时,为什么还要导入math?
math 进行标量运算,因为例如,math.sqrt 在标量上运行时比np.sqrt 快一个数量级.
我认为没有一个函数可以在一次调用中完成所有这些。不过你可以在scipy.stats找到高斯概率密度函数。
所以我能想到的最简单的方法是:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.stats import norm
# Plot between -10 and 10 with .001 steps.
x_axis = np.arange(-10, 10, 0.001)
# Mean = 0, SD = 2.
plt.plot(x_axis, norm.pdf(x_axis,0,2))
plt.show()
来源:
【讨论】:
norm.pdf 更改为norm(0, 1).pdf。这使得更容易适应其他情况/理解这会生成一个表示随机变量的对象。
Unutbu 的答案是正确的。 但是因为我们的平均值可能大于或小于零,所以我仍然想更改它:
x = np.linspace(-3 * sigma, 3 * sigma, 100)
到这里:
x = np.linspace(-3 * sigma + mean, 3 * sigma + mean, 100)
【讨论】:
如果您更喜欢循序渐进的方法,您可以考虑如下解决方案
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
mean = 0; std = 1; variance = np.square(std)
x = np.arange(-5,5,.01)
f = np.exp(-np.square(x-mean)/2*variance)/(np.sqrt(2*np.pi*variance))
plt.plot(x,f)
plt.ylabel('gaussian distribution')
plt.show()
【讨论】:
您可以轻松获得 cdf。所以通过 cdf 生成 pdf
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.interpolate
import scipy.stats
def setGridLine(ax):
#http://jonathansoma.com/lede/data-studio/matplotlib/adding-grid-lines-to-a-matplotlib-chart/
ax.set_axisbelow(True)
ax.minorticks_on()
ax.grid(which='major', linestyle='-', linewidth=0.5, color='grey')
ax.grid(which='minor', linestyle=':', linewidth=0.5, color='#a6a6a6')
ax.tick_params(which='both', # Options for both major and minor ticks
top=False, # turn off top ticks
left=False, # turn off left ticks
right=False, # turn off right ticks
bottom=False) # turn off bottom ticks
data1 = np.random.normal(0,1,1000000)
x=np.sort(data1)
y=np.arange(x.shape[0])/(x.shape[0]+1)
f2 = scipy.interpolate.interp1d(x, y,kind='linear')
x2 = np.linspace(x[0],x[-1],1001)
y2 = f2(x2)
y2b = np.diff(y2)/np.diff(x2)
x2b=(x2[1:]+x2[:-1])/2.
f3 = scipy.interpolate.interp1d(x, y,kind='cubic')
x3 = np.linspace(x[0],x[-1],1001)
y3 = f3(x3)
y3b = np.diff(y3)/np.diff(x3)
x3b=(x3[1:]+x3[:-1])/2.
bins=np.arange(-4,4,0.1)
bins_centers=0.5*(bins[1:]+bins[:-1])
cdf = scipy.stats.norm.cdf(bins_centers)
pdf = scipy.stats.norm.pdf(bins_centers)
plt.rcParams["font.size"] = 18
fig, ax = plt.subplots(3,1,figsize=(10,16))
ax[0].set_title("cdf")
ax[0].plot(x,y,label="data")
ax[0].plot(x2,y2,label="linear")
ax[0].plot(x3,y3,label="cubic")
ax[0].plot(bins_centers,cdf,label="ans")
ax[1].set_title("pdf:linear")
ax[1].plot(x2b,y2b,label="linear")
ax[1].plot(bins_centers,pdf,label="ans")
ax[2].set_title("pdf:cubic")
ax[2].plot(x3b,y3b,label="cubic")
ax[2].plot(bins_centers,pdf,label="ans")
for idx in range(3):
ax[idx].legend()
setGridLine(ax[idx])
plt.show()
plt.clf()
plt.close()
【讨论】:
我刚刚回到这个问题,我必须安装 scipy,因为 matplotlib.mlab 在尝试上面的示例时给了我错误消息 MatplotlibDeprecationWarning: scipy.stats.norm.pdf。所以现在的示例是:
%matplotlib inline
import math
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import scipy.stats
mu = 0
variance = 1
sigma = math.sqrt(variance)
x = np.linspace(mu - 3*sigma, mu + 3*sigma, 100)
plt.plot(x, scipy.stats.norm.pdf(x, mu, sigma))
plt.show()
【讨论】:
改用 seaborn 我正在使用 seaborn 的 distplot,mean=5 std=3 of 1000 个值
value = np.random.normal(loc=5,scale=3,size=1000)
sns.distplot(value)
你会得到一条正态分布曲线
【讨论】:
import math
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy
import pandas as pd
def normal_pdf(x, mu=0, sigma=1):
sqrt_two_pi = math.sqrt(math.pi * 2)
return math.exp(-(x - mu) ** 2 / 2 / sigma ** 2) / (sqrt_two_pi * sigma)
df = pd.DataFrame({'x1': numpy.arange(-10, 10, 0.1), 'y1': map(normal_pdf, numpy.arange(-10, 10, 0.1))})
plt.plot('x1', 'y1', data=df, marker='o', markerfacecolor='blue', markersize=5, color='skyblue', linewidth=1)
plt.show()
【讨论】: