强制 conda 环境中的 rpy2 在 conda 环境之外使用 R

Question

我开始使用 conda 环境。我知道我可以打开和使用 R jupiter notebook，但我首选的工作流程是在必要时在 python notebook 中使用 R，并在两种语言之间使用 rpy2 和推/拉数据

%R push data
%R run something
%R pull output

但是现在当我在 conda 环境中运行 rpy2 时，它会搜索 conda 环境中 R 文件夹中的所有包。我想使用安装在我的主目录或我工作的机器中的软件包，而无需为每个 conda 环境重新安装所有内容。这可能吗？

Answer 1

有几种方法可以告诉 R 包目录 (http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/libPaths.html)。

尝试设置环境变量 R_LIBS 或 R_LIBS_USER（在笔记本中 %load_ext rpy2.ipython 之前）。