我想通过我的 Anaconda 环境之一使用 rpy2。我通过打开该环境的终端并按照these instructions 运行conda install -c r rpy2 来安装它。我也跑了pip install rpy2just to make sure，但是回来了 Requirement already satisfied: rpy2 in c:\users\rcardoso\.conda... »
在 Jupyter Notebook 或控制台中加载 rpy2 给我带来了以下错误： Traceback (most recent call last): File "/home/louis/anaconda3/lib/python3.5/runpy.py", line 184, in _run_module_as_main "__main__", mod_spec)... »
请任何人帮助我，我在 pip install rpy2==3.2.7 时得到了这些： 收集轮 使用缓存的https://files.pythonhosted.org/packages/8c/23/848298cccf8e40f5bbb59009b32848a4c38f4e7f3364297ab3c3e2e2cd14/wheel-0.34.2-py2.py3-none-any.whl 安装收集... »
自然的 Python 等价于 R 中的命名列表是一个字典，但 RPy2 给你一个 ListVector 对象。 import rpy2.robjects as robjects a = robjects.r('list(foo="barbat", fizz=123)') 此时，a 是一个ListVector 对象。 <ListVector - Python:0x108f92a28 ... »
我在系统中有一个.RData 文件，其中包含三个对象 - 全部为 R-DataFrames。我想将它们作为 pandas DataFrames 加载到 python 中。我得到的问题是，对象不是通过rpy 加载的，只有它们的名称： from rpy2.robjects import r from rpy2.robjects import pandas2ri import pandas as pd... »
我目前正在尝试使用 rpy2 访问“R”DTW（动态时间扭曲）包来计算多元时间序列之间的距离。也许因为时间序列真的不同，我收到了错误"No warping path exists that is allowed by costraints" 我认为库中的默认步进模式是对称的，但我想用非对称步进模式对其进行测试，但是当我尝试将步进模式设置为“不对称”时，玩具代码不起作用。以下是代码 import... »
我正在尝试使用rpy2.robjects.lib.grid.viewport() 在一张图中绘制多个子图，代码如下： from rpy2.robjects.lib import grid from rpy2.robjects.packages import importr import rpy2.robjects.lib.ggplot2 as ggplot2 from rpy2 import r... »
寻求有关在 python 脚本中使用 rpy2 和来自 WSL 的 vscode 的帮助。我无法让导入工作。 如果我尝试运行以下代码： import rpy2 print(rpy2.__version__) 我得到以下属性错误： AttributeError: partially initialized module 'rpy2' has no attribute '__version__' ... »
我有一个2D numpy 数组，我将其转换为R matrix，现在我需要将其进一步转换为named list： rpy2.robjects.numpy2ri.activate() nr,nc = counts.shape r_mtx = robjects.r.matrix(counts, nrow=nr, ncol=nc) 所以，我得到了矩阵r_mtx，但我不确定如何从中创建一个命名列表，类... »
有没有办法为 rpy2 对话的 R 实例预加载库？我将 25-30% 的响应时间（每张图表大约 0.5 秒）用于对 lattice 或 grdevices 的导入调用，并且希望尽可能减少。 代码sn-p： grdevices = importr('grDevices') importr('lattice') imagefile = File(open('1d_%s.png' % str(u... »
我已经在这里引用了这篇文章。 converting a Python list to an R numeric vector 我遇到了同样的错误，但提供的解决方案对我不起作用，所以我将其发布。我在Linux中使用的是python 2.7和rpy2对应的最新版本 我尝试使用rpy2从python调用R函数，我的前几行如下。 import rpy2.robjects as robjects fr... »
在使用 pandas 读入一个 .csv 文件，然后使用 rpy2 包将其转换为 R 数据帧后，我使用一些 R 函数（也通过 rpy2）创建了一个模型，现在想对模型进行总结并将其转换为 Pandas 数据框（以便我可以将其保存为 .csv 文件或将其用于其他目的）。 我已经按照 pandas 网站上的说明（来源：https://pandas.pydata.org/pandas-docs/sta... »
python中Rpy2中下面R代码的等价物是什么？ Var1 = c("navy", "darkgreen") names(Var1) = c("Class1", "Class2") ann_colors = list(Var1 = Var1) 不清楚ann_colors 是什么。在 R 中评估时，它给出： > ann_colors $Var1 Class1 Cl... »
我在 Python 中使用 rpy2 包时遇到了一些问题。 实际上，我试图通过传递一些参数来调用一个名为 upliftRF 的函数（R 中的库“uplift”）。 如https://cran.r-project.org/web/packages/uplift/uplift.pdf 第 27 页所述，函数的参数之一可以是 x 或描述模型的公式，以基于数据框（参数中的“数据”参数）进行拟合。 在 R ... »
我有一个 Python 字典列表如下（来自 sqlite3 行工厂）： obs = [{'ave': 0.027, 'pap': 0.277}, {'ave': 0.29, 'pap': 0.333}, {'ave': 0.25, 'pap': 0.5}] 我想将其转换为 R data.frame 以便与rpy2（版本 2.3.6）一起使用，使其看起来像这样 ave pap... »
在 R 中，可以使用命令 anova(fit1,fit2) 比较两个拟合模型 fit1 和 fit2。 但是，如果我们尝试使用接口 Rpy2 类似地执行此操作，它总是会出错。单个模型的方差分析，比如 anova(fit1) 可以通过 Rpy2 计算。 使用两个时出现的错误是： no method for coercing this S4 class into a vector. 所以，我想知道如... »
我要翻译： library(copula) myCop.clayton <- archmCopula(family="clayton", dim =7, param=2) myMvd <- mvdc(copula=myCop.clayton, margins=c("norm", "norm"), paramMargins = list(list(m... »
我正在尝试将一些数据从 python 传递到 R，然后将结果重新调整到 python，但似乎无法让它工作。 我成功地将我的数据传递给 R 并在数据上运行我的自定义函数，甚至获得输出。我被卡住的地方是将统计输出作为数据框返回到 python 中。我尝试过使用 rpy2，甚至将其导出到 .csv 文件以重新导入，但无法让任何一种方法起作用。当我尝试将其推回 pandas 时，我收到一个无法强制执行的错... »
我正在尝试使用 Rpy2 中的 forecast 包。我不知道如何在 rpy2 中将列表转换为时间序列，所以我认为 pandas 时间序列也可以。 from rpy2.robjects.packages import importr from rpy2.robjects import r fore = importr("forecast") from pandas import * data ... »
我正在尝试在 Jupyter 中使用内置的 R 进度条 (txtProgressBar) 和 %%R 魔法。虽然它在 R 控制台或 RStudio 中执行时确实会产生漂亮的动画，但它不会在带有 rpy2 扩展名的 Jupyter（笔记本或实验室）中产生所需的输出，而是在完成后立即打印所有步骤（这使得进度吧没用）。两个问题： 我怎样才能让它工作？ 如果还不可能，我该如何在 rpy2 端实现此功能... »