在 jupyter notebook 中在 R 和 Python 之间共享变量

Question

如何将 R 变量传递给 Python？

在 jupyternotebook 中，我使用 %reload_ext rpy2.ipython 在一个笔记中使用 R 和 Python。我知道如何通过使用将 python 变量传递给 R %%R -i xxx 将 python 变量 xxx 传递给单元格中的 R，但是如何将 R 变量传递回 python？技术上可行吗？

Answer 1

以下 Jupyter 魔术代码演示了使用 R 计算 1+2+3 并将结果保存在变量 rvar 中，然后将其传递给 Python。选项-o rvar 指定变量rvar 是Python 环境所必需的output。

%R -o rvar rvar=1+2+3

在另一个单元格上，您可以使用 Python 来操作该变量：

print(rvar)      # [1] 6
print(rvar[0])   # 6.0

对于更复杂的示例，具有多个输出变量：

%%R -o X -o sdx -o xbar
X=c(1,4,5,7);
sdx=sd(X);
xbar=mean(X)

在 (Python) Jupyter notebook 中，您会得到 X、sdx 和 xbar 作为输出。您可以通过运行代码来检查它们：

print('X:', X)
print('X[1]:', X[1])
print('sdx:', sdx)
print('xbar:', xbar)

更多关于R magic的信息可以在here找到。

或者，您可以使用%Rpull 和%Rget 从rpy2 获取对象。

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Updated reference link 正如@lgautier 在评论中所暗示的那样。