【问题标题】:DICOM to NIFTI conversionDICOM 到 NIFTI 的转换
【发布时间】:2022-06-10 23:03:08
【问题描述】:

我已使用 dicom2nifti.dicom_series_to_nifti(case,output_path)DICOM 文件转换为 NIFTI 格式。 但是,当我在 NIFTI 图像上看到标签/基本事实时,它们会出现水平翻转,因此不要为图像中的正确区域显示蒙版。

如何纠正这个问题?先感谢您。 我正在使用 pyradiomics 进行特征提取。为此,我需要 NIFTI 格式的图像和掩码。但是当我将 dicom 图像转换为 nii 图像标签时没有对齐。这里我提供图片供参考。 dicom images and corresponding .nii segmentation

converted nii image and corresponding label

【问题讨论】:

  • 请提供足够的代码,以便其他人更好地理解或重现问题。
  • 您是否尝试过使用numpy.flip(mask, axis=0) 之类的方法沿水平轴翻转地面实况掩码(或使用axis=1 进行垂直翻转)?
  • 嗨,标签和扫描两个dicom文件吗?您是否以相同的方式处理它们?如果您向我们展示您在做什么,我们可能会提供帮助。
  • 我正在使用 pyradiomics 进行特征提取,因此我需要 .nii 格式的图像和标签。我有 dicom 格式的图像和 .nii 格式的标签。

标签: python image-processing medical-imaging nifti


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