无法使用 SRA 工具包中的 fastq-dump，因为在 @INC 中找不到 XML/LibXML.pm答案

【问题标题】：Can't use fastq-dump from SRA Toolkit because can't locate XML/LibXML.pm in @INC无法使用 SRA 工具包中的 fastq-dump，因为在 @INC 中找不到 XML/LibXML.pm
【发布时间】：2020-01-02 15:37:37
【问题描述】：

我正在尝试使用 SRA Toolkit Package https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=toolkit_doc&f=st 中的 fastq-dump 功能我有错误

在@INC 中找不到 XML/LibXML.pm（您可能需要安装 XML::LibXML 模块）（@INC 包含：/Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/site_perl/5.26.2/darwin- thread-multi-2level /Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/site_perl/5.26.2 /Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/5.26.2/darwin-thread-multi-2level /Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/5.26。 2 .) 在 ./fastq-dump 第 13 行。 BEGIN 失败——编译在 ./fastq-dump 第 13 行中止。

我使用

安装了 XML::LibXML 模块

cpan 安装 XML::LibXML

但是，我不断收到同样的错误。

谁能帮忙？

【问题讨论】：

标签： xml bin fastq

【解决方案1】：

我通过完全安装解决了与 SRA Toolkit 2.10 相同的问题

https://github.com/ncbi/sra-tools/issues/219#issuecomment-524331336

【讨论】：