如何更改生存 ctree 对象 r 中生存曲线的颜色答案

【问题标题】：How to change colour of the survival curves in a survival ctree object r如何更改生存 ctree 对象 r 中生存曲线的颜色
【发布时间】：2017-05-26 23:09:45
【问题描述】：

我正在使用派对包（R 软件）制作生存 ctree，我想在终端面板中显示彩色生存曲线。

fitform <- Surv(delai_efs ,evt_efs) ~ age + sexer + ... + bmiins + tailler + 

tree = ctree(formula = fitform, data = taclfknn, controls = ctree_control(teststat = "max", testtype = "Teststatistic")

plot(tree)

我尝试更改集成其他参数（如颜色）或使用 gp = gpar(col=...) 的源代码，但我失败了...

有什么帮助吗？

谢谢

【问题讨论】：

标签： r colors party

【解决方案1】：

这是partykit 包中函数ctree 的解决方案。

您可以为不同类型的终端节点指定绘图参数。您的案例的所有参数都可以找到?node_surv

改变生存曲线的颜色：

plot(tree, terminal_panel=node_surv(tree, col="green"))

【讨论】：

感谢您指出如何解决这个问题以及在哪里可以找到文档。除了指定整个 terminal_panel 参数，您还可以只指定相应的参数 (tp_args)。例如，在运行example("ctree", package = "partykit") 之后，你可以这样做：plot(GBSG2ct, tp_args = list(col = "blue"))
@AchimZeileis：也谢谢大家！
当我运行 : plot(tree, terminal_panel=node_surv(tree, col="green")) 时，我不知道为什么它不起作用，我有这个错误消息：错误survfitKM(X, newY, casewt, ...) ：未使用的参数 (col = "blue") 当我也运行 plot(tree, tp_args = list(col = "blue")) 我也收到此错误消息@Lstat : 谢谢大家！！
看来您使用的是旧的 party 实现，而不是新的（更灵活）partykit 包。有关软件包之间重要更改的一些背景信息，请参阅vignette("ctree", package = "partykit")。
@AchimZeileis，感谢您的回复。是的，我使用了party 包，但现在我使用partykit 包和一个非常简单的树`tree=ctree(formula=fitform,data = taclfknn)` 然后我运行plot(tree,tp_args = list(col = "blue")) 但我想要不同终端面板中每个不同生存曲线的颜色