直方图颜色用 R 中的分类变量填充答案

【问题标题】：Histogram color fills with categorical variables in R直方图颜色用 R 中的分类变量填充
【发布时间】：2014-12-11 13:42:56
【问题描述】：

我正在尝试创建这样的情节：

qplot(carat, data = diamonds, geom = "histogram", fill = color)

但是，我没有使用 x 轴的定量变量，而是使用分类数据。我正在使用这样的数据框：

refBases=c("A","A","A","C","C","C","G","G","G","T","T","T")
altBases=c("C","G","T","A","G","T","A","C","T","A","C","G")
myDF$ref=refBases
myDF$alt=altBases
myDF$Freq=c(5,2,3,6,9,6,8,6,7,4,6,4)

所以，基本上，我希望我的绘图看起来相同，除了 x 轴将是 ref 列的四个箱（A、C、G、T）； y 轴将是频率；颜色图例将是 alt 列中的四个变量（A、C、G、T）。因此，基本上，x 轴上会有四个 ref bin，每个 ref bin 沿 y 轴分为三个部分，颜色图例表示 alt 值。

当我尝试我所期望的时，我得到了一些相当愚蠢的东西：

qplot(ref,Freq,data=myDF,fill=alt)

【问题讨论】：

标签： r histogram categorical-data

【解决方案1】：

您所描述的内容听起来不像直方图（这是用于估计核密度的连续随机变量的非常具体的图）；听起来你只想要一个条形图。我相信这就是你要找的东西

myDF <- data.frame(
    ref=c("A","A","A","C","C","C","G","G","G","T","T","T"),
    alt=c("C","G","T","A","G","T","A","C","T","A","C","G"),
    Freq=c(5,2,3,6,9,6,8,6,7,4,6,4)
)

library(ggplot2)
ggplot(myDF, aes(ref, Freq, fill=alt)) + 
    geom_bar(stat="identity", position="dodge")

【讨论】：