了解 R 子空间包聚类输出答案

【问题标题】：Understanding R subspace package clustering output了解 R 子空间包聚类输出
【发布时间】：2021-06-08 16:53:38
【问题描述】：

与this问题有些相关。

我正在使用 R subspace 包进行子空间聚类。与上面的问题一样，我未能使用通用绘图方法以包原生的方式绘制我的结果集群。下一步是了解命令的输出

CLIQUE(df, xi = 40, tau = 0.2)

看起来像这样：

我了解“对象”是聚类单元的行号，子空间表示进行聚类的数据的维度。但是我看不出如何区分给定维度中的集群。

该文档不包含有关输出的信息。理想情况下，我的目标是用ggplot2 之类的东西或在 3D 中绘制所有集群，你有什么。而且我需要知道哪些单元在相应维度的哪些簇中。

另外，检查输出列表的两个成员中的任何一个的维度是否相同，如下所示：

cluster_result <- clique_model
equalities_matrix <- matrix(
  0L, nrow = length(cluster_result), ncol = length(cluster_result)
)
for (i in 1:length(cluster_result)){
  for (j in 1:length(cluster_result)){
    equalities_matrix[i,j] <- (
      all(cluster_result[[i]]$subspace == cluster_result[[j]]$subspace)
    )
  }
}
sum(equalities_matrix)

答案是否定的。

【问题讨论】：

标签： r cluster-analysis feature-selection

【解决方案1】：

所以，这就是我的研究得出的结论，可能对将来的某人有所帮助。

在上面，上面的 CLIQUE 算法为每组维度输出一个集群，这可能是由于数据或算法的调整。我向数据添加了更多特征，再次运行它，并再次检查输出列表的两个成员中的任何一个的维度是否相同。这一次，是的，有几个维度与sum(equalities_matrix) 相同，产生的数字大于特征数。

总之，算法的输出是一个列表列表，其中每个成员列表代表一个子空间中的一个簇：

subspace ... 使子空间用 TRUE 表示的维度，

objects ...集群的成员。

如果给定子空间中存在多个簇，则具有相同子空间的成员列表将更多，并且该簇的成员不同。

以下是帮助我理解理论的论文：

【讨论】：