在python中将顶点属性添加到加权igraph Graph

【问题标题】：Add vertex attributes to a weighted igraph Graph in python在python中将顶点属性添加到加权igraph Graph
【发布时间】：2016-04-20 19:08:20
【问题描述】：

我正在学习 python-igraph，并且难以处理划分为组件（它们之间没有连接）的图。当我在此图上应用其中一种聚类算法时，它似乎无法正常工作，因此我需要将算法分别应用于每个子图（组件）。因此，为了维护顶点的标识，我想添加一个顶点属性，该属性为我提供原始图中的 id 号。我的图表由weighted adjacency 矩阵构成：

import numpy as np
import igraph

def symmetrize(a):
    return a + a.T - 2*np.diag(a.diagonal())

A = symmetrize(np.random.random((100,100)))

G = igraph.Graph.Adjacency(A.tolist(),attr="weight",mode="UPPER")

看到应该有加vertex attributes的方法，但是不明白怎么用..

【问题讨论】：

标签： python graph igraph

【解决方案1】：

向所有顶点添加顶点属性的工作方式如下：

G.vs["attr"] = ["id1", "id2", "id3", ...]

您还可以将顶点属性附加到单个顶点：

G.vs[2]["attr"] = "id3"

例如，如果您只需要所有顶点的唯一标识符，您可以这样做：

G.vs["original_id"] = list(range(G.vcount()))

（如果您使用的是 Python 2.x，则不需要 list() 部分，因为 range() 已经生成了一个列表）。

【讨论】：