使用 miniconda/conda-forge 安装 g++，无法编译 hello world答案

【问题标题】：Installed g++ with miniconda/conda-forge, can't compile hello world使用 miniconda/conda-forge 安装 g++，无法编译 hello world
【发布时间】：2021-10-09 02:21:14
【问题描述】：

我整天都在寻找这个；它与配置错误有关，但这是一台纯粹通过 miniconda/conda-forge 安装的全新计算机，所以它应该可以工作。

我的 miniconda 配置非常简单：conda-forge 是除默认设置之外的唯一通道 (~/.condarc)：

changeps1: false
channels:
  - conda-forge
  - defaults

它是最新的 (conda update --all)。

GNU C、C++ 和 Fortran 编译器已通过 post-5.0 compiler environment 安装。以下是conda list linux的列表：

# packages in environment at /home/jpivarski/miniconda3:
#
# Name                    Version                   Build  Channel
binutils_impl_linux-64    2.36.1               h193b22a_2    conda-forge
binutils_linux-64         2.36                hf3e587d_33    conda-forge
gcc_impl_linux-64         9.3.0               h6df7d76_17  
gcc_linux-64              9.3.0               hf25ea35_33    conda-forge
gfortran_impl_linux-64    9.3.0               hc4a2995_19    conda-forge
gfortran_linux-64         9.3.0               hdc58fab_33    conda-forge
gxx_impl_linux-64         9.3.0               hbdd7822_17  
gxx_linux-64              9.3.0               h3fbe746_33    conda-forge
kernel-headers_linux-64   2.6.32              he073ed8_14    conda-forge
ld_impl_linux-64          2.36.1               hea4e1c9_2    conda-forge
libgcc-devel_linux-64     9.3.0               hb95220a_17  
libstdcxx-devel_linux-64  9.3.0               hf0c5c8d_17  
sysroot_linux-64          2.12                he073ed8_14    conda-forge

和conda list compiler:

# packages in environment at /home/jpivarski/miniconda3:
#
# Name                    Version                   Build  Channel
c-compiler                1.2.0                h7f98852_0    conda-forge
compilers                 1.2.0                ha770c72_0    conda-forge
cxx-compiler              1.2.0                h4bd325d_0    conda-forge
fortran-compiler          1.2.0                h1990efc_0    conda-forge

和conda list binutil:

# packages in environment at /home/jpivarski/miniconda3:
#
# Name                    Version                   Build  Channel
binutils                  2.36.1               hdd6e379_2    conda-forge
binutils_impl_linux-64    2.36.1               h193b22a_2    conda-forge
binutils_linux-64         2.36                hf3e587d_33    conda-forge

这是一个 Debian 系统，它附带了一个名为 gcc-8-base 的软件包，

gcc-8-base/stable,now 8.3.0-6 amd64 [installed]

但是那个包没有在路径中添加gcc 命令，所以它不是用户可见的。此 Debian 位于 Chromebook 上的 Crostini VM 中 (/proc/version)：

Linux version 5.4.119-14943-gff839c7fedcc (chrome-bot@chromeos-ci-legacy-us-east1-d-x32-83-pa8b) (Chromium OS 12.0_pre422132_p20210405-r4 clang version 13.0.0 (/var/tmp/portage/sys-devel/llvm-12.0_pre422132_p20210405-r4/work/llvm-12.0_pre422132_p20210405/clang cd442157cff4aad209ae532cbf031abbe10bc1df)) #1 SMP PREEMPT Wed Jul 28 21:06:01 PDT 2021

现在，有趣的部分。这是可以想象到的最简单的 C++ 程序：

// #include <iostream>

int main(int argc, char** argv) {
  int x = 2 + 4;
  // std::cout << "hello world" << std::endl;
  return 0;
}

（是的，当它不起作用时，我注释掉了“hello world”。）

使用以下任何一种编译它：

g++ tmp.cpp
g++ -std=c++11 tmp.cpp
g++ -std=c++11 -lstdc++ tmp.cpp

产量

/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: /home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/lib/../lib/libstdc++.so: undefined reference to `aligned_alloc@GLIBC_2.16'
/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: /home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/lib/../lib/libstdc++.so: undefined reference to `clock_gettime@GLIBC_2.17'
collect2: error: ld returned 1 exit status

顺便说一句，ldd /that/long/path/to/libstdc++.so:

./../../x86_64-conda-linux-gnu/lib/../lib/libstdc++.so
        linux-vdso.so.1 (0x00007ffd2e8d1000)
        libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007ef64da8e000)
        libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007ef64d8cd000)
        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007ef64dd92000)
        libgcc_s.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libgcc_s.so.1 (0x00007ef64d8b3000)

没有“找不到”。

我可以使用gcc 编译上述程序（带有注释掉的“hello world”）：

gcc -std=c++11 tmp.cpp

但如果我把 #include <iostream> 和 std::cout 放回去，编译器错误是：

/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: /tmp/cc8BE1Tc.o: warning: relocation against `_ZSt4cout' in read-only section `.text'
/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: /tmp/cc8BE1Tc.o: in function `main':
tmp.cpp:(.text+0x20): undefined reference to `std::cout'
/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: tmp.cpp:(.text+0x25): undefined reference to `std::basic_ostream<char, std::char_traits<char> >& std::operator<< <std::char_traits<char> >(std::basic_ostream<char, std::char_traits<char> >&, char const*)'
/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: tmp.cpp:(.text+0x2f): undefined reference to `std::basic_ostream<char, std::char_traits<char> >& std::endl<char, std::char_traits<char> >(std::basic_ostream<char, std::char_traits<char> >&)'
/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: tmp.cpp:(.text+0x3a): undefined reference to `std::ostream::operator<<(std::ostream& (*)(std::ostream&))'
/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: /tmp/cc8BE1Tc.o: in function `__static_initialization_and_destruction_0(int, int)':
tmp.cpp:(.text+0x6a): undefined reference to `std::ios_base::Init::Init()'
/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: tmp.cpp:(.text+0x7f): undefined reference to `std::ios_base::Init::~Init()'
/home/jpivarski/miniconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda-linux-gnu/9.3.0/../../../../x86_64-conda-linux-gnu/bin/ld: warning: creating DT_TEXTREL in a PIE
collect2: error: ld returned 1 exit status

知道它是如何配置错误的，以及如何修复它吗？我束手无策，因为这是一个全新安装。还没有发生什么奇怪的事情。如果这应该是给 conda-forge 的错误报告，我不知道在哪里发布——我们也将不胜感激。

【问题讨论】：

gcc 失败，因为它链接到 c 库，但不包括 std::cout。至于其余的，也许这是相关的？ stackoverflow.com/questions/64766212/…。您可以尝试使用显式链接 -lstdc++ 的 gcc，但这很奇怪。
这不是我的第三次尝试：g++ -std=c++11 -lstdc++ tmp.cpp？也许需要一个-L 来指向libstdc++.so 的正确目录，以防它选择了错误的目录...
哦，对不起，我特意指的是gcc编译的最后几行。似乎g++ 找到了库，但GLIBC 中的链接器发生了一些奇怪的事情
也许你没有安装正确的 GLIBC 版本。我想 ldd --version 会告诉你的。

标签： c++ linux g++ conda conda-forge

【解决方案1】：

回答：我又从头安装了一遍，这次成功了。

由于我不能同时尝试这两个（这是在磁盘空间有限的 Chromebook 上，所以这不是一个选项），我只能根据不同之处推测原因时间：

我在一个“conda install”命令中安装了所有低级gcc_linux-64、gxx_linux-64等和高级compilers、c-compiler、cxx-compiler，而不是在单独的命令。
我将channel_priority: strict 添加到我的~/.condarc 配置中。

我没有使用高级compilers 包（并让它作为依赖项引入gcc_linux-64、gxx_linux-64 等）的唯一原因是因为我不知道它。在我的第一次安装尝试中，我安装了gcc_linux-64 和gxx_linux-64，它们将它们添加为可通过CC 和CXX 环境变量访问的可执行文件，但不在gcc 和g++ 的路径上。然后，当我意识到compilers 包是为面向用户的gcc 和g++（通过c-compiler 和cxx-compiler）而设计时，我随后安装了它。这些之间的依赖关系可能存在错误的假设，因为conda install 应该使所有这些包彼此一致（尤其是在conda update --all 之后）。这是猜测 #1。

第二次尝试也不同，因为我在instructions I found on conda-forge 之后添加了channel_priority: strict。显然，严格优先级的论据是如此强烈，以至于它将成为 conda 5.0 中的默认值。也许我第一次尝试混合 conda-forge 和默认值？（如果是这样，我不知道为什么我以前从未遇到过这个问题——严格的优先级对我来说是新的，尽管我只使用过两个渠道。）这是猜测 #2，我相信它比猜测更强烈#1.

为了完整起见，我还使用mamba 进行了第二次尝试，而不是 conda（CPU 能力有限；没有时间等待），尽管我认为这不会产生影响。如果是这样，这对 conda 或 mamba 来说都是个坏消息。

我将把这个问答对留给后代，以防其他人遇到类似这样的问题。（如果这样做，您也许可以添加数据来解决上述歧义。）

【讨论】：