使用 ade4 进行典型相关分析

Question

R 的 ade4 包中是否弃用了 cca 函数？

library(ade4)
cca(mammals, environment)

输出

could not find function "cca"

我找不到有关此错误的任何文档。

Answer 1

ade4 包版本 1.7-10 中没有 cca 函数。但是，您可以使用来自基本R 的cancor，如下所示

pop <- LifeCycleSavings[, 2:3]
oec <- LifeCycleSavings[, -(2:3)]
cancor(pop, oec)

已编辑

使用以下代码安装 1.7-4 版本

library(devtools)
install_version("ade4", version = "1.7-4", repos = "http://cran.us.r-project.org")

然后运行

library(ade4)

Answer 2

可能不适用于最新版本的软件包。不过建议使用cca{vegan}，它是vegan 库的形式。