【发布时间】:2022-02-03 04:46:46
【问题描述】:
目标:使用 R 语言将 .fcs 数据作为数据框查看。
流式细胞仪数据采用 .fcs 文件格式。使用flowCore包的读取功能在flowFrame结构生产者中读取文件。我想在 R 中阅读它。如何将其转换为 data.frame 结构?
数据如下:-
【问题讨论】:
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请包含此类对象的最小示例
标签: r dataframe type-conversion
目标:使用 R 语言将 .fcs 数据作为数据框查看。
流式细胞仪数据采用 .fcs 文件格式。使用flowCore包的读取功能在flowFrame结构生产者中读取文件。我想在 R 中阅读它。如何将其转换为 data.frame 结构?
数据如下:-
【问题讨论】:
标签: r dataframe type-conversion
使用 __ 包的 exprs 函数。
虽然它的documentation 没有明确说明这个用例,但它对我有用。
df = fcs@exprs
在哪里,
fcs =read.FCS("File_lcoation", truncate_max_range = FALSE)
要求:-
flowCore (read.FCS)-代码:
if (!require("BiocManager", quiet = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("flowCore")
MetaCyto (exprs)-代码:
if (!require("BiocManager", quiet = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("MetaCyto")
【讨论】: