Linux-awk在一列中寻找两个变量

Question

我有这张桌子：

我相信这是一个电子表格文件。

它总共有数千行和 20 列。我想将所有这些结果过滤到某些列中的特定值。

所以我想找到 1 号染色体（第二列）和 + 链（第七列）以及 A/T 或 C/T（第十列）上的所有 SNP。然后返回与这些匹配的 SNP 的数量。

到目前为止，我已经尝试过这个-

awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"} $1=="chr1" && $7=="+" && $10=="A/T" SNP.txt | wc -l

我只是不知道如何获得第 10 列和/或我想要的。

提前致谢

Answer 1

你的结尾报价不见了

awk -F'\t' '$1=="chr1" && $7=="+" && $10~/^(A|C)\/T$/" {count++}
            END  {print count}' SNP.txt

显然没有在图像上进行测试。假设分隔符是您的脚本中的制表符。

最后一个条件可以改为($10=="A/T" || $10=="C/T")，这样可能更容易阅读。