如何使用python在制表符分隔的文件中逐行合并字段

Question

这是我的制表符分隔文件的两个示例行：

id  reference_rc_001    alternative_rc_001  reference_rc_002    alternative_rc_002  reference_rc_003    alternative_rc_003
id1 0   433 0   0   69

我想每两列合并字段。示例输出应如下所示。这是python脚本的一个步骤。所以必须用python来完成

id  reference_rc_001alternative_rc_001  reference_rc_002alternative_rc_002  reference_rc_003alternative_rc_003
id1 0433    00  690

Answer 1

这看起来真的很可怕，可能是最糟糕的方法，并且可能和驴一样高效，但是...... 我认为它有效。

您需要打开文件，最好使用with，这样您就可以遍历文件中的行。 （许多其他 SO 文章会用一个体面的解释说明这样做，所以我不打算这样做。）

然后在我的演示for循环中使用那段代码：

for line in file:
    items = line.split("\t")
    counters = range(len(items)/2)
    new_items = [items[0]] + [items[1+2*x] + items[2+2*x] for x in counters ]
    new_line = '\t'.join(new_items)
    print new_line

解释一下：

我将每一行拆分为一个列表（使用制表符作为分隔符）。 然后我通过索引列表的 n 和 n+1 元素并将它们添加在一起（作为字符串）来创建一个新列表。 最后，要使用制表符分隔条目重新创建一行文本，我将 joining 将新列表与制表符分隔符一起返回。

希望这可以为您提供解决方案可能需要的部分。