在 mac M1 上构建 h5py 失败答案

【问题标题】：Failed to build h5py on mac M1在 mac M1 上构建 h5py 失败
【发布时间】：2022-01-11 16:31:14
【问题描述】：

我正在尝试在 python 虚拟环境中安装 AlphaFold。在尝试安装依赖项时，我收到此错误：

    ERROR: Could not find a version that satisfies the requirement tensorflow==1.14 (from versions: none)
ERROR: No matching distribution found for tensorflow==1.14

为了解决这个问题，我运行命令：“ pip3 install --upgrade https://storage.googleapis.com/tensorflow/mac/cpu/tensorflow-1.14.0-py3-none-any.whl ”

但在执行此操作时，我会收到一条很长的错误消息：

 In file included from /private/var/folders/r_/bgrrl1md0s5gx95p0q8qjj8h0000gn/T/pip-install-kh7jhw3_/h5py_4b8d652f3fda4ea0a05597c3cbb46b5b/h5py/defs.c:734:
  ./h5py/api_compat.h:27:10: fatal error: 'hdf5.h' file not found
  #include "hdf5.h"
           ^~~~~~~~
  1 error generated.
  error: command '/usr/bin/clang' failed with exit code 1
  ----------------------------------------
  ERROR: Failed building wheel for h5py
Failed to build h5py
ERROR: Could not build wheels for h5py, which is required to install pyproject.toml-based projects

我尝试了以下命令，但没有成功并出现同样的错误：

"brew install hdf5" (它已安装，但 h5py 安装仍然无法找到 hdf5.h 文件) “sudo -H pip3 安装 h5py” “点安装 h5py”

【问题讨论】：

标签： python tensorflow hdf5 apple-m1 h5py

【解决方案1】：

您需要先导出HDF5_DIR 环境变量。

运行：

$ export HDF5_DIR=/opt/homebrew/Cellar/hdf5/1.12.1/
$ pip install --no-binary=h5py h5py

【讨论】：

确认这对我有用。就我而言，我试图通过pip install tensorflow-macos 安装 TensorFlow，但我遇到了与 OP 相同的错误。导出HDF5_DIR 为我修复了它（我不必使用--no-binary 标志）。

【解决方案2】：

brew install hdf5
从ls /opt/homebrew/Cellar/hdf5/获取版本号，我的是1.13.0
导出该目录以便 h5py 可以看到它：

export HDF5_DIR=/opt/homebrew/Cellar/hdf5/[version number]/

我的是：export HDF5_DIR=/opt/homebrew/Cellar/hdf5/1.13.0/
尝试再次安装 pip（tensorflow 或 h5py）。

【讨论】：