如何调整 heatmap.3 中的列标签答案

【问题标题】：How to adjust column labels in heatmap.3如何调整 heatmap.3 中的列标签
【发布时间】：2015-11-17 16:53:16
【问题描述】：

以下是我的 heatmap.3 代码：

heatmap.3(x = as.matrix(res), dist.FUN = dist2, scale = 'row', color.FUN = col_ylgnbu, 
                           cex.main = 2, trace = 'none', srtCol = 45, adjCol = c(1,0.1),
                           main = paste(title), 
                           key = T, cexRow = 2, cexCol = 1)

我使用此代码得到以下热图：

我的问题是如何调整列标签以使其不与热图重叠？

谢谢！

【问题讨论】：

标签： r heatmap

【解决方案1】：

您可以将 adjCol 设置为居中对齐，offsetCol 将标签向下移动：

heatmap.3(x = as.matrix(res), dist.FUN = dist2, scale = 'row', 
    color.FUN = col_ylgnbu, 
    cex.main = 2, trace = 'none', srtCol = 45, 
    adjCol = c(1,0), offsetCol=1
    main = paste(title), 
    key = T, cexRow = 2, cexCol = 1)

【讨论】：

它给了我以下错误：In plot.window(...) : "adjCol" is not a graphical parameter In plot.window(...) : "offsetCol" is not a graphical parameter
看脚本，adjCol 应该只在 srtCol 为 NULL 的情况下才有效，你之前看到过这个错误吗？
是的，我以前也看到过这个错误。我确实希望列名旋转 45 度并垂直调整。所以我想我会同时使用 adjCol 和 srtCol。但是，似乎 heatmap.3 并没有像众所周知的那样真正继承 heatmap.2 的所有参数。
是的，添加文本时似乎有问题，没有更改文本位置的选项。 text(1:nc,.sideCol,labels=labCol,srt=srtCol,pos=1,xpd=TRUE,cex=cexCol)