深拷贝并返回实例 Java

Question

所以我正在做一个大学一年级作业的问题，我会诚实地对待它。我只是想在你们中的一些人对我的问题投反对票之前把事情说清楚。我不想要完整的代码，我只是想要一些帮助。

问题分为两部分。第一部分是编写一个 Nucleotide 类，它的构造函数有两个属性。称为 base 的单个字符必须是 'a' 或 'c' 或 'g' 或 't' 否则它应该是 'n' 和一个称为 degenerate 的布尔值。

这部分的代码在这里：

class Nucleotide {
    private char base;
    private boolean degenerate;

    public nucleotide(char base, boolean degenerate){
      if(base != ‘a’ || base != ‘c’ || base != ‘g’ || base != ’t’){
        this.base = ’n’;
      } else {
          this.base = base;
      }
      this.degenerate = degenerate;
    }
}

问题的下一部分说使用 Nucleotide 对象并创建一个新的 Bacteria 类。一个细菌实例由一个基因组（核苷酸的集合）和一个物种（一个字符串）组成。

您必须创建一个接受字符串和集合的构造函数，并使用它们来 初始化物种和核苷酸的集合。 我这部分的代码在这里：

class Bacteria {
  //private ArrayList<Nucleotide> genome;
  private String species;

  public Bacteria(String species, ArrayList<Nucleotide> genome) {
    genome = new ArrayList<Nucleotide>();
    this.species = species;
  }

我的问题从下一步开始，它要求我们编写一个实例方法来执行深度复制并返回一个 Bacteria 实例。

public Bacteria binaryFission() {

如何在没有序列化和反射的情况下执行深层复制。我对那些事情几乎一无所知。

我再次需要指针或关于如何完成binaryFission() 方法的基本概念。 我已经处理了几个关于 SO 的深层复制问题，但它们都与我的问题无关，所以我不认为我在问重复的问题。我很乐意提供更多详细信息.

Answer 1

这是手动操作的方法

public Bacteria binaryFission() {
    String speciesClone = this.species;
    ArrayList<Nucleotide> genomeClone = new ArrayList<Nucleotide>();
    //now iterate over the existing arraylist and clone each Nucleotide
    for(int index = 0; index < this.genome.size(); index++)
    {
        genomeClone.add(new Nucleotide(
                            genome.get(index).getBase(), //needs to be added to the Nucleotide class to retrieve the base variable
                            genome.get(index).getDegenerate() //needs to be added to be allowed to get its degenerate
                ));
    }

    return new Bacteria(speciesClone, genomeClone);
}

仅供参考 - 您需要为您的 Nucleotide 类私有变量添加 getter 才能正常工作，因为它们是私有的，没有它们，细菌将无法访问它们的值。

Answer 2

由于Nucleotide 没有设置器，并且它的字段是原始的，因此它实际上是不可变的（无法更改，因此可以安全地“重用”）。您最好将字段设置为 final 以正式使其不可变。

制作深拷贝所需要做的就是制作 Nucleotide 列表的浅拷贝，然后在新的 Bacteria 中使用它。你可以这样复制：

List<Nucleotide> copy = new ArrayList<>(genome);

您可以在 Bacteria 上创建一个简单的工厂方法，该方法返回其自身的深层副本：

public Bacteria copy() {
   return new Bacteria(species, new ArrayList<>(genome));
}