R中带有ranger和pdp的平行部分依赖图答案

【问题标题】：Parallel partial dependence plot in R with ranger and pdpR中带有ranger和pdp的平行部分依赖图
【发布时间】：2019-07-01 18:43:35
【问题描述】：

我正在尝试尽可能高效地运行双向部分依赖图（使用并行计算），并且正在使用以下规范


cluster <- makeCluster(detectCores() - 1) # convention to leave 1 core for OS
registerDoParallel(cluster)

partial(cforest_adjusted, 
pred.var = c("avg_mtg_duration", "avg_mtg_attd"), 
trim.outliers = TRUE, chull = TRUE, parallel = TRUE,
grid.resolution = 30)

cforest_adjusted 对象来自使用“maxstat”拆分的游侠库。

我收到以下错误：

: ... 可能用在不正确的上下文中：â.fun(piece, ...)â : ... 可能在不正确的上下文中使用： â.fun(piece, ...)â do.ply(i) 中的错误：任务 1 失败 - “否应用于类对象的“预测”的适用方法 "护林员""

我猜我必须为 do.ply 后端提供一个自定义预测函数，但现在我确定如何做到这一点。

【问题讨论】：

标签： r random-forest

【解决方案1】：

想通了。您需要像这样添加外部库（例如 ranger）：

partial(cforest_adjusted, 
pred.var = c("avg_mtg_duration", "avg_mtg_attd"), 
trim.outliers = TRUE, chull = TRUE, parallel = TRUE,
grid.resolution = 30,  paropts = list(.packages = "ranger"))

【讨论】：