如何将 OpenBUGS Coda 文件转换为 R 中的 mcmc 对象？

Question

我使用了 OpenBUGS，它生成了 MCMC 输出的 coda 文件。要计算和绘制 Gelman Rubin 和 Geweke 诊断，我需要将此 coda.odc 文件转换为 R 中的 mcmc 对象吗？有没有办法做到这一点？或者您是否向我推荐了其他一些方法来进行此分析？

谢谢

Answer 1

在coda 包中使用read.coda，...类似于：

library(coda)
my.coda <- read.coda("Chain1.txt", "CODAIndex.txt")

可能适用于 .odc 文件。如果您将 CODA 文件从 OpenBUGS 保存为 .txt，则绝对有效 my.coda 将是一个 mcmc 类型的对象。