在python中使用时间序列数据计算均值、方差std偏差答案

【问题标题】：use time series data in python to calculate mean, variance std deviation在python中使用时间序列数据计算均值、方差std偏差
【发布时间】：2016-11-17 18:27:07
【问题描述】：

我从传感器收集的数据如下：

sec   nanosec value 

1001   1       0.2 

1001   2       0.2

1001   3       0.2 

1002   1       0.1  

1002   2       0.2   

1002   3       0.1 

1003   1       0.2 

1003   2       0.2

1003   3       0.1  

1004   1       0.2   

1004   2       0.2 

1004   3       0.2 

1004   4      0.1

我想计算average,std deviation 和其他一些统计数据，例如每 2 秒一列的最大值、最小值。所以平均 (1001, 1002)= 0.167，平均 (1003,1004)=0.17

从教程http://earthpy.org/pandas-basics.html，我认为我应该将其转换为时间序列并使用 pandas 的滚动 _means，但我是时间序列数据的新手，所以我不确定这是否是正确的方法。另外，我如何在此处指定转换频率，因为第一秒的观察结果较少。因此，对于实际数据，我在 1001 秒内有不到 100 个读数，然后在 1002 秒后有 100 个观察值。

我也可以按秒进行简单的 groupby，但它会每秒而不是每 2 秒对读数进行分组，那么我如何将 groupby 中 2 个连续组的观察结果结合起来，然后进行分析。

【问题讨论】：

标签： python pandas time-series

【解决方案1】：

我认为您可以先将列secto_timedelta、set_index 和resample 转换为2 seconds (2S)：

df['sec'] = pd.to_timedelta(df.sec, unit='s')
df.set_index('sec', inplace=True)
print (df)
          nanosec  value
sec                     
00:16:41        1    0.2
00:16:41        2    0.2
00:16:41        3    0.2
00:16:42        1    0.1
00:16:42        2    0.2
00:16:42        3    0.1
00:16:43        1    0.2
00:16:43        2    0.2
00:16:43        3    0.1
00:16:44        1    0.2
00:16:44        2    0.2
00:16:44        3    0.2
00:16:44        4    0.1

print (df.value.resample('2S').mean())
sec
00:16:41    0.166667
00:16:43    0.171429
00:16:45         NaN
Freq: 2S, Name: value, dtype: float64

print (df.value.resample('2S').std())
sec
00:16:41    0.051640
00:16:43    0.048795
00:16:45         NaN
Freq: 2S, Name: value, dtype: float64

print (df.value.resample('2S').max())
sec
00:16:41    0.2
00:16:43    0.2
00:16:45    NaN
Freq: 2S, Name: value, dtype: float64

也许您需要将base 更改为resample：

print (df.value.resample('2S', base=1).mean())
sec
00:16:42    0.166667
00:16:44    0.171429
00:16:46         NaN
Freq: 2S, Name: value, dtype: float64

print (df.value.resample('2S', base=1).std())
sec
00:16:42    0.051640
00:16:44    0.048795
00:16:46         NaN
Freq: 2S, Name: value, dtype: float64

print (df.value.resample('2S', base=1).max())
sec
00:16:42    0.2
00:16:44    0.2
00:16:46    NaN
Freq: 2S, Name: value, dtype: float64

print (df.value.resample('2S', base=2).mean())
sec
00:16:43    0.166667
00:16:45    0.171429
00:16:47         NaN
Freq: 2S, Name: value, dtype: float64

print (df.value.resample('2S', base=2).std())
sec
00:16:43    0.051640
00:16:45    0.048795
00:16:47         NaN
Freq: 2S, Name: value, dtype: float64

print (df.value.resample('2S', base=2).max())
sec
00:16:43    0.2
00:16:45    0.2
00:16:47    NaN
Freq: 2S, Name: value, dtype: float64

【讨论】：

我认为这可行，但我收到警告尝试使用 .loc[row_index,col_indexer] = value 代替 df1['header_stamp_secs'] = pd.to_timedelta(df1.header_stamp_secs, unit='s' ）。后面跟着一个错误仅对 DatetimeIndex 或 PeriodIndex 有效
有趣。你的熊猫是什么版本的？
我使用的是熊猫 0.13.1
嗯，最新版本是0.18.1，我想你可以升级pandas。

【解决方案2】：

借用 jezrael 的代码进行设置：

df['sec'] = pd.to_timedelta(df.sec, unit='s')
df.set_index('sec', inplace=True)
print (df)
          nanosec  value
sec                     
00:16:41        1    0.2
00:16:41        2    0.2
00:16:41        3    0.2
00:16:42        1    0.1
00:16:42        2    0.2
00:16:42        3    0.1
00:16:43        1    0.2
00:16:43        2    0.2
00:16:43        3    0.1
00:16:44        1    0.2
00:16:44        2    0.2
00:16:44        3    0.2
00:16:44        4    0.1

使用pd.TimeGrouper('2S') 和describe()

df.groupby(pd.TimeGrouper('2S')).describe()

【讨论】：