在 bash 脚本中使用 bsub lsf 调用 bash 函数答案

【问题标题】：call bash function with bsub lsf within bash script在 bash 脚本中使用 bsub lsf 调用 bash 函数
【发布时间】：2013-08-19 20:43:31
【问题描述】：

我有一个 bash 函数，我想要 bsub。当我尝试获取脚本时会递归调用它，但如果我不获取脚本，它似乎无法识别我的功能。如何在同一个脚本文件中的函数上正确调用 besub？

my_script（应该打印“12345”）：

#! /bin/sh
function myFunct {
echo $1
}

bsub -q myQueue "source ./my_script; myFunct 12345"

【问题讨论】：

标签： bash lsf

【解决方案1】：

a.bash 可能看起来像这样

#! /bin/bash

export input=$1
function myFunct {
echo "$input"
}

# This is if you want to call bsub outside the bash
#  Use bsub -q Queue `./a.bash 12345`

myFunct "$input"  


# Put bsub inside and call the script
# ./a.bash 12345

bsub -q myQueue `myFunct "$input"`

【讨论】：

谢谢。如果我想在 a.bash 中调用 bsub 会怎样？我想这样做是因为我的实际代码中有一个 forloop。
你可以写成bsub -q Queue `myFunct "$input"`，而不是myFunct "$input"。然后执行为./a.bash 12345
..thx 再次..但它似乎无法找到 myFunct。我通过将 echo "$input" 替换为 'mkdir myDir' 对其进行了测试，但没有创建任何内容。有什么想法吗？
Notice $input 是您必须提供给脚本的参数。还要检查您的脚本的权限。粘贴执行脚本时显示的错误。
让我们continue this discussion in chat

【解决方案2】：

我已经可以使用它了

bsub [...] bash -rcfile my_script.sh -i -c "myFunct 12345"

【讨论】：