使用 qsub 在另一个 bash 脚本中调用 bash 脚本答案

【问题标题】：Calling a bash script inside another bash script using qsub使用 qsub 在另一个 bash 脚本中调用 bash 脚本
【发布时间】：2017-05-26 03:52:34
【问题描述】：

我正在尝试使用 qsub 在另一个 bash 脚本中运行 bash 脚本（因为我需要在集群上运行实际问题）。

这里是这个问题的一个演示。我有两个脚本如下：

脚本 1：

#!/bin/bash -f
sh ./script2.sh

脚本 2：

#!/bin/bash
echo "It works fine!"

现在，如果我将这两个脚本放在一个文件夹中并使用命令sh script1.sh，它将正常工作。但是如果我使用 qsub 命令来运行它qsub script1.sh 它会报错：

sh: ./script2.sh: 没有这样的文件或目录

我该如何解决？

【问题讨论】：

【解决方案1】：

定义用于作业的工作目录路径 -d 选项可以使用。如果未指定，则默认工作目录为主目录。

检查您的工作目录。

#!/bin/bash -f
echo "Working directory is $PWD"
sh ./script2.sh

您可以使用-d 选项来解决此问题。

qsub -d <working directory> script1.sh

【讨论】：