【问题标题】:how can I color-scrolling in heatmap.2如何在 heatmap.2 中进行颜色滚动
【发布时间】:2020-01-08 18:13:54
【问题描述】:

如何为 heat map.2 中的 Color-Key 进行颜色滚动? 我的意思是我只想显示蓝色区域。

heatmap.2(mat, Rowv = F, Colv = F, dendrogram = "none", trace = "none", 
          col = bluered(100), key = TRUE, key.xlab = "", key.ylab = "")

【问题讨论】:

    标签: r colors heatmap


    【解决方案1】:

    这里的问题有点不清楚。您似乎在询问如何编辑树状图。应该有一个 reorder 参数,您可以编辑它以获得您想要的效果。Link to heatmap.2 function from gplots package

    【讨论】:

    • 我的数据有 log10(p 值),我想进行截断,以便只显示蓝色部分。这意味着白色区域转移到 -2 例如而不是 0。我该怎么做?
    • 尝试更改 colsep 参数。这应该有助于操纵颜色的划分。您需要通过更改此函数的 sepwidth 参数来更改 colsep 和 rowsep。看来这里仍在使用默认值,即 (.05,.05)。
    • 有这些选项 sepcolor = "blue", sepwidth = c (1, 1),我试过了,可惜没用。我不知道是什么问题。
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