LSF bsub 等待变量答案

【问题标题】：LSF bsub waiting with variableLSF bsub 等待变量
【发布时间】：2015-03-06 15:34:35
【问题描述】：

我有一个问题要说，job1 在 LSF 中使用变量名动态等待 job2，这是我的代码

#!/bin/bash

JOB1=first
JOB2=second

bsub -I -q reg -J $JOB1 "ls /bin*" &
bsub -I -q reg -w 'done("$JOB1")' -J $JOB2 ls /usr/ &"

【问题讨论】：

标签： bash dependency-injection wait jobs lsf

【解决方案1】：

几个猜测。

bash 不会扩展单引号内的变量。你可能是这个意思
```
bsub -I -q reg -w "done($JOB1)" -J $JOB2 "ls /usr/ &"
```

提交第二个作业时，LSF 可能不知道第一个作业。由于第一个 bsub 在后台运行，两个 bsub 相互“竞争”。第二个 bsub 可能在第一个之前与 mbatchd 对话。 strace 表明这是可能的。

[pid  8413] 18:48:30.533859 execve(".../bsub", ["bsub", "-I", "-J", "first", "ls /bin/*"], [/* 45 vars */] <unfinished ...>
[pid  8414] 18:48:30.534415 execve(".../bsub", ["bsub", "-I", "-w", "done(first)", "-J", "second", "ls /usr/ &"], [/* 45 vars */] <unfinished ...>
...
[pid  8414] 18:48:30.572521 connect(5, {sa_family=AF_INET, sin_port=htons(6881), sin_addr=inet_addr("a.b.c.d")}, 16 <unfinished ...>
[pid  8413] 18:48:30.573422 connect(5, {sa_family=AF_INET, sin_port=htons(6881), sin_addr=inet_addr("a.b.c.d")}, 16 <unfinished ...>

【讨论】：