在 R 中可视化强连通分量答案

【问题标题】：Visualize strongly connected components in R在 R 中可视化强连通分量
【发布时间】：2015-05-07 15:17:18
【问题描述】：

我有一个带有三个强连通分量 (SCC) 的加权有向图。 SCC 是从igraph::clusters 函数获得的

library(igraph)
SCC<- clusters(graph, mode="strong")  
SCC$membership
 [1] 9 2 7 7 8 2 6 2 2 5 2 2 2 2 2 1 2 4 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2
SCC$csize
[1]  1 21  1  1  1  1  2  1  1
 SCC$no
[1] 9

我想用圆形和彩色背景来可视化 SCC，如下图所示，在 R 中有什么方法可以做到这一点？谢谢！

【问题讨论】：

为了给您提供真正的答案，我们需要您的数据和一个最小的工作示例。另请参阅：stackoverflow.com/questions/5963269/…
你看过igraph绘图函数的参数mark.groups吗：?plot.igraph？

标签： r graph

【解决方案1】：

看看plot.igraph 的mark.groups 参数。像下面这样的东西可以解决问题：

# Create some toy data
set.seed(1)
library(igraph)
graph <- erdos.renyi.game(20, 1/20)

# Do the clustering
SCC <- clusters(graph, mode="strong")  

# Add colours and use the mark.group argument
V(graph)$color <- rainbow(SCC$no)[SCC$membership]
plot(graph, mark.groups = split(1:vcount(graph), SCC$membership))

【讨论】：