在运行 Linux 的 Cray 系统上，如何在自动 BASH 脚本中使用 aprun 提交多个 qsub 请求？

Question

具体来说，Cray 需要嵌入在 qsub 请求中的特殊命令 (aprun) 才能在批处理节点上执行作业（Cray 默认在没有 aprun 语法的登录/计算节点上运行）。当向 Cray Linux 超级计算机手动键入 qsub 请求时，定向语法为：

qsub <qsub parameters> -V
aprun -n #CPUS /executable.exe param1 param2 ...
Ctrl-D

用户在-V（表示qsub 语句中的参数通道）和可执行文件/参数集之后提供“return”。 Ctrl-D 终止输入并执行qsub/aprun 命令。

问题是，网上描述了多种在 BASH 脚本中输入 Ctrl-D（简单的意思是 EOF）的方法，但它们都不能在 qsub 的上下文中工作-嵌入aprun 命令。

我需要做的是在一个脚本中对多个qsub/aprun 命令执行相同的语法。如何在 BASH 中编码？

Answer 1

解法语法为：

qsub <qsub parameters> -V <<EOF 
cd 
aprun -n #CPUS /executable.exe param1 param2 ... 
EOF 

qsub <qsub parameters> -V <<EOF 
cd 
aprun -n #CPUS /executable.exe param1 param2 ... 
EOF 

注意<<EOF 的位置（cd 位于新行上，后跟带有aprun 语法的换行符和集合中的最终EOF没有前导 <<，后跟换行符。

此语法会将每个qsub/aprun 命令执行到一个新的批处理节点作业提交中。脚本的输出将是一系列请求的作业 ID。