【问题标题】:Format of output for seqecmpgroup() function?seqecmpgroup() 函数的输出格式?
【发布时间】:2015-01-14 16:08:16
【问题描述】:

seqecmpgroup() 函数返回一个表格,其中包括每个指定组的频率。但是,当我运行它时,它会生成低于 1 的频率(例如 0.00035)。我是否应该将这些频率解释为显示每个子序列出现在多少组中的百分比?

下面我粘贴了一个示例输出(每组的频率被列为“Freq.1”、“Freq.2”等:

      Subsequence     Support     p.value statistic index      Freq.1
1      (FA)-(IN)-(FA) 0.004807692 0.002293660 12.155213   538 0.000000000
2 (NR)-(TR)-(EX)-(IN) 0.004807692 0.002293660 12.155213   685 0.000000000
3 (NR)-(TR)-(IN)-(IN) 0.004807692 0.002293660 12.155213   687 0.000000000
4      (IS)-(IS)-(NR) 0.019230769 0.006788125  9.985161    98 0.040322581
5      (FA)-(NR)-(QU) 0.012820513 0.009031434  9.414088   172 0.008064516
       Freq.2     Freq.3    Resid.1   Resid.2   Resid.3
1 0.000000000 0.02419355 -1.0919284 -1.100699  3.113347
2 0.000000000 0.02419355 -1.0919284 -1.100699  3.113347
3 0.000000000 0.02419355 -1.0919284 -1.100699  3.113347
4 0.007936508 0.00000000  2.3951978 -1.292885 -1.544220
5 0.003968254 0.04032258 -0.6614769 -1.241085  2.704727

Computed on 624 event sequences
  Constraint Value
  countMethod  COBJ

【问题讨论】:

    标签: r traminer sequence-analysis


    【解决方案1】:

    频率实际上是相对频率。它们对应于每组内的相对支持度,也就是说,它们表示每组中包含子序列的组中序列的比例。

    例如,我们从您的结果中得知,第一个子序列 (FA)-(IN)-(FA) 从未出现在前两组中,并且是第 3 组序列的 2.4% 的子序列。

    提供时,比例会考虑序列权重。

    现在,我在您的示例输出中看不到任何负频率。并且您指示的 0.00035 的值不低于 0!

    【讨论】:

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