运行具有泊松族和偏移量的游戏时出错答案

【问题标题】：Error when running a gam with poisson family and offset运行具有泊松族和偏移量的游戏时出错
【发布时间】：2019-03-05 23:47:13
【问题描述】：

我正在尝试在 R 中运行游戏，但收到一条奇怪的错误消息。

一般来说，我有一些计数，每体积的水采样，我想通过这个计数来纠正。我正在尝试生成一个平滑函数，该函数适合作为深度函数的计数，考虑到采样体积的差异。

test <- structure(list(depth = c(2.5, 7.5, 12.5, 17.5, 22.5, 27.5, 32.5, 
37.5, 42.5, 47.5, 52.5, 57.5, 62.5, 67.5, 72.5, 77.5, 82.5, 87.5, 
92.5, 97.5), count = c(53323, 665, 1090, 491, 540, 514, 612, 
775, 601, 497, 295, 348, 357, 294, 292, 968, 455, 148, 155, 101
), vol = c(2119.92, 111.76, 156.64, 71.28, 77.44, 73.92, 62.48, 
78.32, 74.8, 81.84, 53.68, 80.96, 80.08, 79.2, 79.2, 77.44, 77.44, 
84.48, 73.04, 59.84)), class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame"
), row.names = c(NA, -20L), .Names = c("depth", "count", "vol"
))

gam(count ~ s(depth) + offset(vol), data = test, family = "poisson")

Error in if (pdev - old.pdev > div.thresh) { : missing value where TRUE/FALSE needed

知道为什么这不起作用吗？如果我摆脱了偏移量，或者我设置了family = "gaussian"，那么函数就会按预期运行。

编辑：我发现

gam(count ~ s(depth) + offset(log(vol)), data = test, family = "poisson")

确实运行了，我想我看到有人说想要为这些记录转换偏移变量，所以也许这实际上工作正常。

【问题讨论】：

标签： r poisson gam mgcv

【解决方案1】：

你肯定需要把vol放在对数刻度上（对于这个模型）。

更一般地，偏移量以链接函数的比例进入模型。因此，如果您的模型使用 family = poisson(link = 'sqrt')，那么您需要包含偏移量为offset(sqrt(vol))。

我怀疑错误来自假设 vol 值在对数刻度上而初始模型拟合而引起的可能性/偏差中的一些溢出或错误值。

【讨论】：