python中的变量聚类

Question

我有数百个具有二进制值的变量，即 1 和 0，我想看看这些变量如何落入不同的集群？我没有看到任何可应用的 python 方法。但我可以在 R 中看到一个：http://arxiv.org/pdf/1112.0295.pdf

例如，我有变量（特征）a1、a2、a3、a4、.......、a100 的数据。每个 a 都是二进制变量。我不想对观察应用聚类，而是想对 a1,a2,...,a100 应用聚类，并希望查看 a1 落在哪些聚类中或 a2 落在哪些聚类中。

有没有人知道python中类似的包或方法？我尝试在 Anaconda 中应用 R 接口，以便我可以使用 R 方法，但接口不起作用。

Python 3.4.3 |Anaconda 2.3.0（64 位）|

Answer 1

首先转置您的数据矩阵。

然后集群特征而不是实例！

Answer 2

scikit-learn 包正是您想要的。

它包含很多聚类算法，如K-means、Affinity propagation、Mean-shift、Spectral clustering、Ward hierarchical clustering、Agglomerative clustering、DBSCAN、Gaussian Mixtures等等。