在 Python 中绘制聚类图

Question

我已经有办法对我的图进行聚类，所以聚类过程不是这里的问题。我想要做的是，一旦我们将所有节点都聚集在一起 - 在 Python 中绘制聚集图，如下所示：

我查看了 networkx、igraph 和 graph-tool，但它们似乎进行了聚类，而不是绘图。关于我应该使用什么库来绘制已经聚集的图的任何想法和建议，这将最大限度地减少交叉链接的数量？

Answer 1

看看 GraphViz http://www.graphviz.org/Gallery/directed/cluster.html 有一个 Python 绑定，但我不得不说我总是直接创建文本文件，因为它们很容易编写。不要被看似简单的示例所迷惑，您的图表的每个方面都是高度可定制的，您可以使用它制作一些非常漂亮的图表可视化。虽然不确定嵌套集群，但从未尝试过。