重新排序 PBS 队列中的项目

Question

我向 PBS 提交了几份工作。现在，我希望我最后提交的工作是第一个。

一种选择是保留所有预览作业（使用 qhold ）。问题是我使用-W depend=afterok: 开关以便在预览作业结束后启用作业。

因此，我的 PBS 队列看起来像这样：

468743.server   username    queue_name job1         4828   6  36   46gb 24:00 R 16:12
468744.server   username    queue_name job1_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468745.server   username    queue_name job1_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468746.server   username    queue_name job1_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468747.server   username    queue_name job1_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468748.server   username    queue_name job1_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468743.server   username    queue_name job2         4828   6  36   46gb 24:00 R 16:12
468744.server   username    queue_name job2_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468745.server   username    queue_name job2_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468746.server   username    queue_name job2_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468747.server   username    queue_name job2_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468748.server   username    queue_name job2_cont     --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468753.server   username    queue_name NewJob        --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468754.server   username    queue_name NewJob_cont        --    6  36   46gb 24:00 H   -- 
468755.server   username    queue_name NewJob_cont        --    6  36   46gb 24:00 H   -- 

现在，我希望 NewJob（最后上线）在 {job1, job2} 中的第一个作业完成之后，并且在任何“_cont”之前运行。我希望 NewJob_cont 作业将在 NewJob 之后运行。

我可以改变 NewJob 的位置而不破坏其余的保持队列层次结构吗？

Answer 1

您可以使用 qalter 更改作业的依赖关系。你可以执行：

qalter 468744 -W depend=after:468753
qalter 468753 -W depend=after:468743

这将使 468744 直到新作业之后才执行，并且新作业直到第一个作业之后才执行。正如您可以在队列作业中添加后依赖项一样，您也可以添加其他类型的依赖项。