【问题标题】:converting voxels in DICOM to mm^3将 DICOM 中的体素转换为 mm^3
【发布时间】:2012-03-08 09:18:12
【问题描述】:

我正在将 DICOM 文件中体素中的一些 3D 区域转换为 mm^3。我想在这里确定一下,因为我只有 DICOM 文件,我无法测量这些我想要的 3D 区域,单位为 mm^3。

在 DICOM 文件中,我看到我可以访问体素大小,因此,例如,如果我得到体素计数,我会选择:

mm^3 = voxelCount * (voxelWidth * voxelHeight * voxelDepth)

这听起来合乎逻辑,但不知何故我觉得我可能遗漏了一些东西。在DICOM文件中,还有“切片间距”、“切片厚度”等其他信息。

那么通常情况下,为生成此类计算公式必须考虑哪些变量?我们如何计算这个?

【问题讨论】:

标签: image math 3d dicom


【解决方案1】:

您需要阅读描述图像平面模块的标准第 3 部分的 C.7.6.2 节。简而言之,PixelSpacing 属性 (0028, 0030) 为您提供体素宽度和高度。 SliceThickness (0018, 0050) 告诉您深度。请注意,切片之间可能存在间隙。

http://medical.nema.org/Dicom/2011/11_03pu.pdf

【讨论】:

  • 我不认为切片厚度告诉我我正在寻找的“深度”。 CT 中的标称切片厚度定义为扫描场中心的灵敏度分布的半峰全宽 (FWHM);其值可由操作者根据临床需要选择,一般在1mm~10mm之间。一般来说,切片厚度越大,图像中的低对比度分辨率越大;切片厚度越小,空间分辨率越高。
  • 我认为 (0018,0088) 切片之间的间距,以毫米为单位,可能是我正在寻找的这个“深度”。间距是从每个切片的中心到中心测量的。
  • (0018,0088) 切片之间的间距特定于 MR 和 NM 图像,它是可选的,因此您不能指望存在的信息。如果您有一个多帧 RT Dose 图像,您将能够从 (3004,000C) Grid Frame Offset Vector 获得切片之间的间距。否则 (0018,0050) 切片厚度是最通用的,并且(尽管它不需要有值)可能是您最好的选择。
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