如何关联 NIFTI 格式的不同 MRI 序列图像？答案

【问题标题】：How to correlate different MRI sequences images in NIFTI format?如何关联 NIFTI 格式的不同 MRI 序列图像？
【发布时间】：2023-03-26 07:29:02
【问题描述】：

我是医学成像的新手。我正在处理 MRI 图像，即 T2 和 DWI。

我用nib.load 上传了两张图片，但每张序列图片都有不同数量的切片（体积、深度？）。如果我选择一个切片（z坐标），如何在另一个序列图像上获得相应的切片？ ITK 做得正确，所以也许 NIFTI 标头中的某些内容可以提供帮助？

非常感谢您的阅读！我也尝试过插值，但没有奏效。

【问题讨论】：

标签： python registration coordinate-systems itk medical-imaging

【解决方案1】：

如果 ITK 做得对，为什么不直接使用 ITK？

如果你坚持手动滚动自己的索引物理空间转换例程，看看 ITK computes those matrices 和可公开访问的 methods which use them 是如何实现的。对于特定于 NIFTI，请查看 ITK 的 NIFTI reader，它在 itk::Image 中设置了相关元数据。

【讨论】：

【解决方案2】：

读取 NIFTI，即仿射，并提取平移变换矩阵以创建从 T2 到 DWI 体素的映射。

提示：尼巴贝尔。

【讨论】：